code review

Для начала давай-ка пройдемся по классам

Класс PlayController
    нейминг:
    лучше не писать названия такими
    public Rigidbody2D playerRb;
    лучше их писать полностью, так легче читать и понимать код
    public Rigidbody2D playerRigidbody;
    В целом по названиям почитай какие есть соглашения о наименованиях (про кодстайл и все остальное ещё в конце написал):
    https://docs.microsoft.com/ru-ru/dotnet/csharp/fundamentals/coding-style/coding-conventions

    два вот этих метода:
    void FixedUpdate()
    {
        Vector2 movement = new Vector2(movementX * playerSpeed, playerRb.velocity.y);
        playerRb.velocity = movement;
    }
    void Jump()
    {
        Vector2 movement = new Vector2(playerRb.velocity.x, jumpForce);
        playerRb.velocity = movement;
    }
    в целом ты можешь писать и так, но лучше не расписывать и просто писать следующим образом:
    void FixedUpdate()
    {
        playerRigidBody.velocity = new Vector2(movementX * playerSpeed, playerRigidBody.velocity.y);
    }
    void Jump()
    {
        playerRigidBody.velocity = new Vector2(playerRigidBody.velocity.x, jumpForce);
    }

    метод isGrounded()
        Тут довольно-таки стандартная ошибка новичка при работе с булевыми операциями, как ты увидишь их можно спокойно сокращать и
        делать свой код более читаемым
    вместо
    if (checkGround != null)
    {
        return true;
    }
    return false;
    лучше писать
    return
        checkGroung != null;

Теперь вот такой момент с дублированием классов
public class rotaProf : MonoBehaviour
{
    void OnTriggerEnter2D(Collider2D Enemy)
    {
        SceneManager.LoadScene(1);
    }
}
public class rotaProf1 : MonoBehaviour
{
    void OnTriggerEnter2D(Collider2D Enemy)
    {
        SceneManager.LoadScene(2);
    }
}
Как я правильно понял, ты ещё не до конца научился правильно обращаться с классами и всем остальным, но это норма для новичка
Суть твоей ошибки тут в том, что у тебя два класса выполняют одно и то же действие, но только лишь с небольшим различием.
Самый лучший способ решения такой проблемы это задание в классе поля, допустим какое-то id, и использование его значения в методе:
public class rotaProf : MonoBehaviour
{
    public int id {private get; set;}

    void OnTriggerEnter2D(Collider2D Enemy)
    {
        SceneManager.LoadScene(id);
    }
}
Все что тебе останется это просто взять и задать ему какое-то значение через редактор в юньке или ещё каким-либо образом

Аналогично с SceneSwap и SceneSwap1:
public class SceneSwap : MonoBehaviour
{
    private void OnGUI()
    {
        int xCenter = (Screen.width / 2);
        int yCenter = (Screen.height / 2);
        int width = 100;
        int height = 50;

        GUIStyle fontSize = new GUIStyle(GUI.skin.GetStyle("button"));
        fontSize.fontSize = 25;

        Scene scene = SceneManager.GetActiveScene();

        if (scene.name == "3")
        {
            // Show a button to allow scene2 to be switched to.
            if (GUI.Button(new Rect(xCenter - width / 2, yCenter - height / 2, width, height), "Play!", fontSize))
            {
                SceneManager.LoadScene("1");
            }
        }
        else
        {
            // Show a button to allow scene1 to be returned to.
            if (GUI.Button(new Rect(xCenter - width / 2, yCenter - height / 2, width, height), "Заново", fontSize))
            {
                SceneManager.LoadScene("1");
            }
        }
    }
}

public class SceneSwap1 : MonoBehaviour
{
    private void OnGUI()
    {
        int xCenter = (Screen.width / 8);
        int yCenter = (Screen.height / 8);
        int width = 80;
        int height = 40;

        GUIStyle fontSize = new GUIStyle(GUI.skin.GetStyle("button"));
        fontSize.fontSize = 14;

        Scene scene = SceneManager.GetActiveScene();

        if (scene.name == "3")
        {
            // Show a button to allow scene2 to be switched to.
            if (GUI.Button(new Rect(xCenter - width / 2, yCenter - height / 2, width, height), "Play!", fontSize))
            {
                SceneManager.LoadScene("1");
            }
        }
        else
        {
            // Show a button to allow scene1 to be returned to.
            if (GUI.Button(new Rect(xCenter - width / 2, yCenter - height / 2, width, height), "Заново", fontSize))
            {
                SceneManager.LoadScene("1");
            }
        }
    }
}

Как тут можно заметить, разнятся только лишь две переменные: width и height, проделаем для них то же самое, что и для id в rotaProf:
public class SceneSwap : MonoBehaviour
{

    public buttonWidth { get; set; }
    public buttonHeight { get; set; }

    private void OnGUI()
    {
        int xCenter = (Screen.width / 2);
        int yCenter = (Screen.height / 2);

        GUIStyle fontSize = new GUIStyle(GUI.skin.GetStyle("button"));
        fontSize.fontSize = 14;

        Scene scene = SceneManager.GetActiveScene();

        if (scene.name == "3")
        {
            // Show a button to allow scene2 to be switched to.
            if (GUI.Button(new Rect(xCenter - buttonWidth / 2, yCenter - buttonHeight / 2, buttonWidth, buttonHeight), "Play!", fontSize))
            {
                SceneManager.LoadScene("1");
            }
        }
        else
        {
            // Show a button to allow scene1 to be returned to.
            if (GUI.Button(new Rect(xCenter - buttonWidth / 2, yCenter - buttonHeight / 2, buttonWidth, buttonHeight), "Заново", fontSize))
            {
                SceneManager.LoadScene("1");
            }
        }
    }
}

В целом если ещё и есть какие-то ошибки, то они скорее всего заключаются в том же, что я описал выше, поэтому не буду лишний раз повторяться.
Скорее всего будут какие-то ошибки в коде с методами и функциями из юньки, но по ним ничего не могу сказать, ибо с юнити давно не работал


Итак, что могу посоветовать:
1. Пункт про кодстайл. Прочитай книгу "Чистый код", она может быть чуток и устарела, но на примере Java тебе объяснят как правильно
   работать с кодом, оформлять его и т.д.
   Вот тут вроде бы рабочая ссылка
   https://download.blackball.lv/data/library/Chistyj_kod_-_Sozdanie_analiz_i_refaktoring_%282013%29.pdf
2. Читай книги. Да, это никому не интересно, но в программировании чтение книг это один из самых доступных и надежных путей для
   получения новых знаний
3. Разберись в ООП, т.е. это очень важная штука в программировании, по началу ты может быть и не будешь её так много использовать в
   проектах, но все это будет продолжаться до тех пор, пока ты не научишься мыслить абстракциями
   Материалы по ООП хорошие на метаните: ( https://metanit.com/sharp/tutorial/3.7.php )
4. Математика. Не знаю как тебе, но лично мне в классе 7-9 математика была не особо интересна, но в геймдеве она может пригодится и ещё
   как, поэтому не забивай на нее в школе. Если есть желание, советую интересоваться темами из матеши, которые связаны с геймдевом.
   Большинство из этих тем скорее всего будут из высшей математики, но ты можешь попробовать в них разобраться, они только по началу
   кажутся страшными и неподъемными
   Вот статья про геймдев и математику: https://proglib.io/p/math-for-game-development
5. Как можно больше практикуйся и тренируйся работать с алгоритмами
   На этом сайте, например, ты можешь тренироваться в решении всяких задач ( https://edabit.com/ )