<?php
$data = array('2016-11-01','2016-11-07','2016-11-14');
$jumhari = cal_days_in_month(CAL_GREGORIAN,'11','2016');
?>
<table border="1">
    <thead>
        <tr>
            <?php for ($a=1; $a<=$jumhari; $a++) { ?>
                <th><?php echo $a ?></th>
            <?php } ?>
        </tr>
    </thead>
    <tbody>
        <tr>
            <?php
            for ($i=1; $i <= $jumhari ; $i++) {
                $date = '2016-11-' . str_pad($i, 2, '0', STR_PAD_LEFT);
                //disini tinggal cek apakah $date ada di dalam $data atau tidak, tidak perlu di-foreach
                if ( in_array ( $date , $data ) ) {
                    echo "<td><strong>".$date."</strong></td>";
                } else {
                    echo "<td> None </td>";
                }
            }
            ?>
        </tr>
    </tbody>
</table>