from Tkinter import *
import tkMessageBox
import tkSimpleDialog
...


ventana = Tk()
ventana.title("AutoGestion de Conexiones AUTOCON")
ventana.resizable(0,0)
ventana.config(bg="red")
ventana.config(bd=10)
ventana.config(relief="groove")
ventana.config(cursor="tcross")

principal=Frame()

principal.pack(fill="y", expand="True")

tkMessageBox.showinfo("BIENVENIDO", "En sus marcas!")

principal.config(bg="white")
principal.config(width="1000", height="384")
principal.config(bd=10)
principal.config(relief="ridge")
principal.config(cursor="hand2")

logo=PhotoImage(file="logo.gif")

Label(principal, text="AutoGestion de Conexiones AUTOCON", fg="red", font=("Swis721 BlkEx BT Negra", 30)).place(x=50, y=50)
Label(principal, image=logo).place(x=780, y=50)

def comandos():
try:
    #solicitamos los datos al usuario
    usuario=tkSimpleDialog.askstring("USUARIO", "Coloque el usuario:")
    clave=tkSimpleDialog.askstring("CONTRASENA", "Coloque la contrasena AAA:", show="*")

    #leemos el archivo listaip.txt y comandos.txt
    #en comandos.txt escribimos los comandos a enviar a los equipos remotos
    archivo1 = open("listaip.txt","r")
    archivo2 = open("comandos.txt","r")
    archivo3 = open("objetivo.txt","w")
    #guardamos en un archivo los resultados obtenidos al final del recorrido
    #leemos lo que contiene los archivos e igualamos a las variables del bucle
    terminales = archivo1.readlines()
    comandoss = archivo2.readlines()
    #bucle que recorre de acuerdo a las n cantidas de direcciones ip activas
    for host in terminales:
        #rstrip eliminamos los espacios que pudieren quedar antes o despues del salto de linea
        host = host.rstrip()
        for command in comandoss:
            #bucle que funciona de acuerdo a la cantidad de direcciones ip almacenadas en el archivo listaip.txt
            command = command.rstrip()
            name = socket.getfqdn()
            #eliminamos los espacios vacios
            #inicializamos el cliente ssh
            ssh = paramiko.SSHClient()
            #leemos la clave local
            ssh.set_missing_host_key_policy(paramiko.AutoAddPolicy())
            #efectuamos la conexion
            ssh.connect(host, username=usuario, password=clave)
            stdin, stdout, stderr = ssh.exec_command(command)
            #leemos la salida
            salida = stdout.read()
            #creamos una lista vacia
            lista =[]
            #anadimos los elementos de la salida al final de la lista
            lista.append(salida)
            #esto es para verificar en consola que si esta ejecutandose correctamente
            print "ok"
            #escribimos en el archivo
            archivo3.write(str((host + ":" + salida +" establecido con exito" + "n" )))
            ssh.close()
            #cerramos la conexion y todos los archivos
    archivo1.close()
    archivo2.close()
    archivo3.close()
except:
    error1 = "nError al ejecutar la conexion!n"
    tkMessageBox.showinfo("Resultado", error1)

barra = Menu(ventana)
...
#menucomandos
menucomandos = Menu(barra, tearoff=1)
menucomandos.add_command(label="Aplicar comandos escritos en los archivos",
command=comandos)
barra.add_cascade(label="Comandos",menu=menucomandos)

ventana.config(menu=barra)

ventana.mainloop()