const byte digit_pins[2] = {5,6}; // пины для переключения индикатора
const byte indication_pins[7] = { 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107 }; // пины куда прицеплены индикаторы

unsigned long tm, next_flick, secs;
const unsigned int to_flick = 1; // как часто переключать индикацию
const unsigned int change_every_sec = 1; // как часто увеличивать счетчик

byte digit = 0;
unsigned int counter = 1; // старт счетчика
const unsigned int max_counter = 100; // максимальное значение счетчика

// какие пины надо выставлять в высокий уровень
// чтобы получилась нужная цифра
const byte digits[10] = {
    B11101110,
    B10000010,
    B11011100,
    B11010110,
    B10110010,
    B01110110,
    B01111110,
    B11000010,
    B11111110,
    B11110110
};

// выставляем цифру на индикаторе
void fill( byte d ){
    for(char i=0; i<8; i++){
        digitalWrite(indication_pins[i], digits[d] & (1<<i));
    }
}

// выставляем число на индикаторах
void setDigit( byte digit, unsigned int counter ){
    byte d = 0;
    switch ( digit ){
        case 0:
            digitalWrite(digit_pins[1], LOW);
            d = counter % 10;
            fill(d);
            digitalWrite(digit_pins[0], HIGH);
            break;
        case 1:
            digitalWrite(digit_pins[0], LOW);
            d = (counter % 100) / 10;
            fill(d);
            digitalWrite(digit_pins[1], HIGH);
            break;

        // эта часть не нужна, если у тебя 2 индикатора
        //case 2:
        //    digitalWrite(digit_pins[1], LOW);
        //    d = ( counter % 1000 ) / 100;
        //    fill(d);
        //    digitalWrite(digit_pins[2], HIGH);
        //    break;
    }
}

void setup() {
    for(int i=0; i<2; i++)
    {
        pinMode(digit_pins[i], OUTPUT);
    }

    for (int i = 0; i < 8; i++)
    {
        pinMode(indication_pins[i], OUTPUT);
    }

    pinMode(13, OUTPUT);
}

void loop() {
    tm = millis();
    if (tm > secs)
    {
        secs = tm + change_every_sec;
        counter++;

        if (counter >= max_counter)
            counter = 1;
    }

    if( tm > next_flick ){
        next_flick = tm + to_flick;
        digit++;
        if( digit == 2 )
            digit = 0;

        setDigit( digit, counter );
    }
}