$(document).ready(function () {
    $('.nav a[href^="#"]').click(function (){ //выбрать ссылки из меню
        var offset = $('.nav').innerHeight();//высота меню, получаем динамически
        var targer = $(this).attr('href');//Сохраняем значение аттрибута href
        $('html, body').animate({
            scrollTop: $(target).offset().top - offset //вычесть высоту меню
        }, 500/* время анимации */);
        $('.nav a[href^="#"').removeClass('active');//удалить класс у всех пунктов меню
        $(this).addClass('active');//добавить класс активной ссылке
        return false;
    });
});