SHOW:
|
|
- or go back to the newest paste.
| 1 | import os | |
| 2 | ||
| 3 | sok = input("Skriv inn DNA-sekvensen du ønsker å søke etter: ")
| |
| 4 | - | avvik = int(input("Hvor mange basemutasjoner er tillatt?: "))
|
| 4 | + | avvik = int(input("Antall tillatte basemutasjoner: "))
|
| 5 | print("\n")
| |
| 6 | ||
| 7 | mappe = "c:/Systematikk/" | |
| 8 | for fil in os.listdir(mappe): | |
| 9 | print("Funn i", fil)
| |
| 10 | funn = [] | |
| 11 | fo = open(mappe+fil) | |
| 12 | linje = fo.readline() | |
| 13 | linjenummer = 1 | |
| 14 | while linje != '': | |
| 15 | - | base = list(linje) #Gjør om linjen til enkelt-karakterer slik at de kan sammenlignes en-og-en. |
| 15 | + | base = list(linje) #Gjør om linja til enkelt-tegn, slik at de kan sammenlignes enkeltvis. |
| 16 | - | del base[-1] #Fjerner linjeskift-kommandoen \n som ligger skjult i enden av hver linje i txt-dokumentet. |
| 16 | + | del base[-1] #Fjerner linjeskift-kommandoen \n, som ligger skjult til slutt på hver linje i TXT-filen. |
| 17 | score = 0 | |
| 18 | linjesok = "Linje "+str(linjenummer)+": "+sok | |
| 19 | linjesok = list(linjesok) | |
| 20 | for i in range(len(linjesok)): | |
| 21 | if base[i] != linjesok [i]: | |
| 22 | score += 1 | |
| 23 | - | if score <= avvik: #Hvis mindre enn antallet avvik finnes, vil linjen legges til listen funn. |
| 23 | + | if score <= avvik: #Hvis søket gir færre avvik enn dette antallet, legges linja til på lista over funn. |
| 24 | resultat = "Sekvens funnet i " | |
| 25 | - | for i in range(len(base)): #For lesbarhet gjøres listeelementene om til en string |
| 25 | + | for i in range(len(base)): #Listeelementene gjøres om til en streng for å øke lesbarheten. |
| 26 | resultat = resultat+base[i] | |
| 27 | funn.append(resultat) | |
| 28 | linjenummer += 1 | |
| 29 | linje = fo.readline() | |
| 30 | print (funn,"\n") | |
| 31 | fo.close |
