df1

                                  EW       WE      DA     dd   AA
0                             cheese     fdwa  waddcv   21.0  NaN
1                             cheese  dwadwad    dwad  231.0  NaN
2                             cheese      dwa  waddcv    3.0  NaN

df2

       AD   FA     BA        DA    daw
0  Cheese  1.0  300.0         T      T
1  dwadaw  3.0  400.0        21  31232


df3 = df2[['AD', 'FA']].copy()
print('FA')

time.sleep(1)
df3.FA=np.where(df2.AD.isin(df1.EW),df3.FA,np.nan)
print (df3)

I get:

       AD   FA
0  Cheese  NaN
1  dwadaw  NaN
2     NaN  4.0
3     NaN  5.0
4     NaN  NaN
5     NaN  NaN
6     NaN  NaN
7     NaN  NaN
8     NaN  NaN
9     NaN  NaN

When I want:
       AD   FA
0  Cheese   1