mkdir projTotal
cd projTotal
git init
git commit --allow-empty -m "Initial commit"

#add any number of projects
git remote add -f proj git@proj.git
git merge --allow-unrelated-histories proj/master
mkdir subProj
ls -a -1 > proj.files
vim proj.files
#remove manually subProj, proj.files, .git, ., ..
for f in $(cat proj.files); do git mv $f subProj; done
rm proj.files
git commit -a -m "Move proj files to subdir"