new try

public class Test {

    private double percentile = 0.00;
    private double median = 0.00;
    private double maxValue = Double.MIN_VALUE;
    private double minValue = Double.MAX_VALUE;
    private double avrgValue = 0.00;

    public void main(String[] args) throws IOException {
        if (args.length < 1) {
            System.out.println("Ошибка: отсуствует файл с входными данными");
        }
        Scanner reader = new Scanner(new FileInputStream(args[0]));
        int linesInFile = reader.nextInt();
        double[] data = new double[linesInFile];
        for (int i = 0; i <= linesInFile; i++) {
            double number = Double.parseDouble(reader.nextLine().trim());
            BigDecimal numberForCompare = BigDecimal.valueOf(number);
            numberForCompare.setScale(2, RoundingMode.CEILING);
            if (numberForCompare.compareTo(BigDecimal.valueOf(maxValue)) > 0) {
                maxValue = numberForCompare.doubleValue();
            }
            if (numberForCompare.compareTo(BigDecimal.valueOf(minValue)) < 0) {
                minValue = numberForCompare.doubleValue();
            }
            data[i] = number;
        }

        for (int i = 0; i < data.length; i++) {
            //TODO здесь написать код, который тебе нужен
        }
    }
}