Advertisement
Guest User

Untitled

a guest
Mar 29th, 2017
61
0
Never
Not a member of Pastebin yet? Sign Up, it unlocks many cool features!
Bash 2.14 KB | None | 0 0
  1. #!/bin/bash
  2. #PBS -N /user/scratch/gent/gvo000/gvo00003/vsc41771/esterification/ester-vasp/reviewer_answer/hydroxy-0-empty
  3.  
  4. #PBS -m ae
  5.  
  6. #PBS -q debug
  7.  
  8. #PBS -l walltime=00:59:00
  9.  
  10. #PBS -l nodes=1:ppn=all
  11.  
  12. #PBS -A lt_pilot_06
  13.  
  14. module purge
  15. export VSC_INSTITUTE_CLUSTER=swalot
  16. ulimit -s unlimited
  17.  
  18. module load cluster
  19.  
  20. module load jobs
  21. module load scripts
  22. #module load VSC-tools/0.1.5
  23. #module unload ictce
  24. module load VASP/5.4.1-intel-2015b-mt-vaspsol-20150914-O2
  25. module list
  26. #export I_MPI_FABRICS=dapl
  27. #newgrp g_vasp5
  28.  
  29. cd /user/scratch/gent/gvo000/gvo00003/vsc41771/esterification/ester-vasp/reviewer_answer/hydroxy-0-empty
  30. #mkdir /local/vasp
  31. #cd /local/vasp
  32. free -m
  33. date
  34.  
  35. rm /user/scratch/gent/gvo000/gvo00003/vsc41771/esterification/ester-vasp/reviewer_answer/hydroxy-0-empty/tempout
  36. #cp /user/scratch/gent/gvo000/gvo00003/vsc41771/esterification/ester-vasp/reviewer_answer/hydroxy-0-empty/* /local/vasp
  37. mympirun --output /user/scratch/gent/gvo000/gvo00003/vsc41771/esterification/ester-vasp/reviewer_answer/hydroxy-0-empty/tempout vasp
  38. #mympirun vasp
  39. #cp /local/vasp/* /user/scratch/gent/gvo000/gvo00003/vsc41771/esterification/ester-vasp/reviewer_answer/hydroxy-0-empty
  40. mympirun --output /user/scratch/gent/gvo000/gvo00003/vsc41771/esterification/ester-vasp/reviewer_answer/hydroxy-0-empty/tempout vasp      
  41. #mympirun vasp                                                                                                                            
  42. #cp /local/vasp/* /user/scratch/gent/gvo000/gvo00003/vsc41771/esterification/ester-vasp/reviewer_answer/hydroxy-0-empty                  
  43. free -m                                                                                                                                  
  44. date                                                                                                                                      
  45.                                                                                                                                          
  46. exit 0
Advertisement
Add Comment
Please, Sign In to add comment
Advertisement