Header 1
Codigo : c001
Nombre : Juan
Total  : 45,78



Header 1
c001
Nombre : Juan
Cantidad : 23
Subtotal : 45.89

Total     : 3410.67

Header 1
Codigo : c002
Nombre : Ana
Total  : 45.89
Header 1
c001
Nombre : Juan
Cantidad:4

/(Header1.*?c001.*?)Header1/ism

^Header 1(?:R(?!Header ).*+)*?

/^Header 1$(?:R(?!Header ).*+)*?RNombre : Juan$(?:R(?!Header ).*+)*/mi

R(?:Codigo : )?c001$

R.*bc001$

R.*c001.*+

$regex = '/^Header 1$(?:R(?!Header ).*+)*?RNombre : Juan$(?:R(?!Header ).*+)*/mi';

if (preg_match_all($regex, $texto, $resultado)) {
    //mostrar secciones
    $n = 0;
    foreach ($resultado[0] as &$seccion) {
        echo "n-----Seccion " . ++$n . "-----n";
        echo $seccion;
    }
} else {
    echo "No se encontró el nombre";
}