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a guest Sep 23rd, 2019 78 Never
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  1. sessionInfo()                                                                   R version 3.5.1 (2018-07-02)
  2. Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
  3. Running under: Debian GNU/Linux 9 (stretch)
  4.  
  5. Matrix products: default
  6. BLAS: /fsimb/common/tools/R/3.5.1/lib/R/lib/libRblas.so
  7. LAPACK: /fsimb/common/tools/R/3.5.1/lib/R/lib/libRlapack.so
  8.                                                                                                                                                                                          
  9. locale:
  10.  [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C                                                                                                                                            
  11.  [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8                                                                                                                                  
  12.  [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8                                                                                                                                  
  13.  [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                                                                                                                                                
  14.  [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C                                                                                                                                          
  15. [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C                                                                                                                                      
  16.                                                                                                                                                                                          
  17. attached base packages:
  18.  [1] grid      stats4    parallel  stats     graphics  grDevices utils
  19.  [8] datasets  methods   base
  20.                                                                                                                                                                                          
  21. other attached packages:
  22.  [1] makeitprettier_0.1     ggthemes_4.2.0         scales_1.0.0
  23.  [4] ggplot2_3.2.1          ChIPseeker_1.18.0      rtracklayer_1.42.2
  24.  [7] GenomicFeatures_1.34.8 AnnotationDbi_1.44.0   Biobase_2.42.0
  25. [10] GenomicRanges_1.34.0   GenomeInfoDb_1.18.2    IRanges_2.16.0
  26. [13] S4Vectors_0.20.1       BiocGenerics_0.28.0    data.table_1.12.2
  27. [16] magrittr_1.5
  28.                                                                                                                                                                                          
  29. loaded via a namespace (and not attached):
  30.  [1] bitops_1.0-6
  31.  [2] matrixStats_0.54.0
  32.  [3] enrichplot_1.2.0
  33.  [4] bit64_0.9-7
  34.  [5] RColorBrewer_1.1-2
  35.  [6] progress_1.2.0
  36.  [7] httr_1.4.1
  37.  [8] UpSetR_1.3.3
  38.  [9] tools_3.5.1
  39. [10] R6_2.4.0
  40. [11] KernSmooth_2.23-15
  41. [12] DBI_1.0.0
  42. [13] lazyeval_0.2.2
  43. [14] colorspace_1.4-1
  44. [15] withr_2.1.2
  45. [16] tidyselect_0.2.5
  46. [17] gridExtra_2.3
  47. [18] prettyunits_1.0.2
  48. [19] bit_1.1-14
  49. [20] compiler_3.5.1
  50. [21] xml2_1.2.0
  51. [22] DelayedArray_0.8.0
  52. [23] triebeard_0.3.0
  53. [24] caTools_1.17.1.2
  54. [25] ggridges_0.5.1
  55. [26] stringr_1.4.0
  56. [27] digest_0.6.20
  57. [28] Rsamtools_1.34.1
  58. [29] DOSE_3.8.2
  59. [30] XVector_0.22.0
  60. [31] pkgconfig_2.0.2
  61. [32] plotrix_3.7-6
  62. [33] rlang_0.4.0
  63. [34] RSQLite_2.1.1
  64. [35] gridGraphics_0.3-0
  65. [36] TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene_3.2.2
  66. [37] farver_1.1.0
  67. [38] jsonlite_1.6
  68. [39] gtools_3.8.1
  69. [40] BiocParallel_1.16.6
  70. [41] GOSemSim_2.8.0
  71. [42] dplyr_0.8.3
  72. [43] RCurl_1.95-4.12
  73. [44] ggplotify_0.0.4
  74. [45] GO.db_3.7.0
  75. [46] GenomeInfoDbData_1.2.0
  76. [47] Matrix_1.2-17
  77. [48] Rcpp_1.0.2
  78. [49] munsell_0.5.0
  79. [50] viridis_0.5.1
  80. [51] stringi_1.4.3
  81. [52] ggraph_1.0.2
  82. [53] MASS_7.3-51.3
  83. [54] SummarizedExperiment_1.12.0
  84. [55] zlibbioc_1.28.0
  85. [56] gplots_3.0.1.1
  86. [57] plyr_1.8.4
  87. [58] qvalue_2.14.1
  88. [59] blob_1.1.1
  89. [60] gdata_2.18.0
  90. [61] ggrepel_0.8.0
  91. [62] DO.db_2.9
  92. [63] crayon_1.3.4
  93. [64] fortunes_1.5-4
  94. [65] lattice_0.20-38
  95. [66] Biostrings_2.50.2
  96. [67] cowplot_0.9.4
  97. [68] splines_3.5.1
  98. [69] hms_0.4.2
  99. [70] pillar_1.4.2
  100. [71] fgsea_1.8.0
  101. [72] igraph_1.2.4
  102. [73] boot_1.3-20
  103. [74] reshape2_1.4.3
  104. [75] biomaRt_2.38.0
  105. [76] fastmatch_1.1-0
  106. [77] XML_3.98-1.20
  107. [78] glue_1.3.1
  108. [79] tweenr_1.0.1
  109. [80] urltools_1.7.3
  110. [81] gtable_0.3.0
  111. [82] purrr_0.3.2
  112. [83] polyclip_1.10-0
  113. [84] assertthat_0.2.1
  114. [85] gridBase_0.4-7
  115. [86] ggforce_0.2.1
  116. [87] europepmc_0.3
  117. [88] viridisLite_0.3.0
  118. [89] tibble_2.1.3
  119. [90] rvcheck_0.1.3
  120. [91] GenomicAlignments_1.18.1
  121. [92] memoise_1.1.0
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