# ファイルを指定してキャッシュを削除（実ファイルは残る）
$ git rm —cached ファイル名


# ディレクトリを指定してキャッシュを削除（実ディレクトリは残る）
$ git rm -r —cached ディレクトリ名



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実ファイル or 実ディレクトリごと削除したい場合は、「--cached」を付けない

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# 実ファイルごと削除
$ git rm ファイル名


# 実ディレクトリごと削除
$ git rm -r ディレクトリ名