==========================
for i in fbin3: # перебираем цифры в первом числе
    if i == "1": # ПЕРВЫЙ IF: если натыкаемся на "1", то:
        for d in sbin2: # перебираем все цифры у второго числа
            if d == i: # и если цифра равна "1" (т.к. по условиям 1го IF'а i = 1), то:
                result.append("1") # в результат приписываем "1"
            else:
                result.append("0")
    else:
        result.append("0")
=========================

Грубо говоря, ты пробегаешься по первому числу и каждый раз, когда натыкаемся на "1", то ты начинаешь пробегаться по второму и ищешь, есть ли там "1". Не на том же месте, а в принципе, есть ли она там в числе. Если есть, то норм, пишем "1".
Скорей всего нужно заменить вот так:

========================
for i, digf in enumerate(fbin3): # i - индекс цифры, digf - сама цифра
    if digf == "1" and sbin2[i] == "1": # ЕСЛИ цифра 1го числа "1" И во втором числе на том же порядковом месте "1", то:
        result.append("1") # в результат приписываем "1"
    else: # в остальных случаях
        result.append("0") # пишем "0"
========================