import pandas as pd

data = {"A":['a','b','c'], "B":[1,2,3], "C":[2,6,7]}
data2 = {"A":['b','a','c'], "B":[0,1,9], "C":[2,2,27]}

df = pd.DataFrame(data)
df2 = pd.DataFrame(data2)

# выбираем из df строки, которые есть в df2 (возможно с другим индексом)
lf = {"A":df2["A"], "B":df2["B"], "C":df2["C"]}
f = df[list(lf)].isin(lf).all(axis=1)
df[f]
# Результат:
A   B   C

# должно быть:
    A   B   C
0   a   1   2

>>> data1 = {"A":['a','b','c','b'], "B":[1,2,3,0], "C":[2,6,7,2]}
>>> data2 = {"A":['b','a','c'], "B":[0,1,9], "C":[2,2,27]}
>>> df1 = pd.DataFrame(data1)
>>> df2 = pd.DataFrame(data2)
>>> pd.merge(df1, df2, how='inner')
   A  B  C
0  a  1  2
1  b  0  2