5. Использование пакетов

В самом языке нет поддержки пакетов. Увы. Так что придется использовать какую-нибудь библиотеку.
Пример такой библиотеки:
function namespace(){};

/**
 * create new namespace if it is not exist
 * @param newNamespace string namespaces like "aaa.dddd.fff"
 */
namespace.prototype.useNamespace = function(newNamespace){

    var namespaces = newNamespace.split(".");
    if (!this[namespaces[0]]){
       this[namespaces[0]] = new namespace();
    }
    if (namespaces.length > 1){
       this[namespaces[0]].useNamespace(newNamespace.substring(namespaces[0].length+1));
    }
};


Далее в приложении создаем корневой пакет…
var app = new namespace();


… и переводим на него наши классы:
app.useNamespace("model.note");

app.model.note.NoteDocument = function(str){
  ...
}

...
var doc = new app.model.note.NoteDocument("hello!");
doc.init();