import os

path = "/path/to/dir/"
dirs = os.listdir(path)
for dir in dirs:
    p1 = os.path.join(path, dir)
    files = os.listdir(p1)
    for file in files:
        # открытие файла, запись куда-то и т.п.
        a = open(os.path.join(p1, file), "r")
        # ...