pandoc input.html -s --latexmathml -o output.html

$ echo '<p>$$x = 4$$</p>' | pandoc -f html+tex_math_dollars -t html --mathml
<p>
  <math display="block" xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML">
    <semantics>
      <mrow><mi>x</mi><mo>=</mo><mn>4</mn></mrow><annotation encoding="application/x-tex">x = 4</annotation>
    </semantics>
  </math>
</p>