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exonerate_protein2dna_bestfit

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Apr 23rd, 2013
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  1. C4 Alignment:
  2. ------------
  3. Query: NM_144550.4 NP_653133.3 spindle and centriole-associated protein 1
  4. Target: RAP32000.1 musRefseq NM_144550.4 Ccdc52 coiled-coil domain containing 52
  5. Model: protein2dna:bestfit
  6. Raw score: 1293
  7. Query range: 0 -> 860
  8. Target range: 54 -> 2134
  9.  
  10. 1 : MetSerLeuIleArgValAsnArgPheGlyProArgGlyGlyGlyArgLysThrLeuLysVa : 21
  11. |||||||||||||||||||||||||||||| !!|||||||||||||||||||||||||||||
  12. MetSerLeuIleArgValAsnArgPheGlySerArgGlyGlyGlyArgLysThrLeuLysVa
  13. 55 : ATGTCATTGATCAGAGTGAATCGCTTTGGTTCCCGGGGAGGTGGAAGAAAAACTCTGAAAGT : 115
  14.  
  15. 22 : lLysLysLysAlaAlaValArgGlnGluTrpAspAsnThrValAsnAspLeuThrValHisA : 42
  16. |||||||||||||:!!||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  17. lLysLysLysAlaSerValArgGlnGluTrpAspAsnThrValAsnAspLeuThrValHisA
  18. 116 : AAAGAAGAAAGCTTCAGTGAGGCAAGAATGGGATAATACTGTGAATGATCTAACAGTGCATC : 178
  19.  
  20. 43 : rgAlaThrProGluAspLeuValArgArgHisGluMetHisLysSerLysAsnArgAlaLeu : 62
  21. |||||||||||||||||||||||||||||||||||!!:||||||||||||||||||||||||
  22. rgAlaThrProGluAspLeuValArgArgHisGluIleHisLysSerLysAsnArgAlaLeu
  23. 179 : GGGCAACTCCTGAAGATCTGGTCCGCCGTCATGAGATACACAAGTCAAAGAATAGAGCATTG : 238
  24.  
  25. 63 : ValHisTrpGluLeuGlnGluLysAlaLeuLysArgLysTrpLysLysGlnLysProGluTh : 83
  26. ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.!
  27. ValHisTrpGluLeuGlnGluLysAlaLeuLysArgLysTrpLysLysGlnLysProGluAl
  28. 239 : GTGCACTGGGAGCTTCAAGAAAAAGCTTTGAAGAGAAAATGGAAGAAGCAGAAACCAGAAGC : 301
  29.  
  30. 84 : rSerSerLeuGluLysArg--LysLeuSerIleMetLysGluIleLeuSerAspGlnTyrLe : 103
  31. !:!!|||||||||||||||##
  32. aAlaSerLeuGluLysArg##-----------------------------------------
  33. 302 : TGCAAGTCTTGAAAAAAGAAG----------------------------------------- : 324
  34.  
  35. 104 : uThrGlnAspValLeuGluLysSerAspHisLeuMetAlaAlaAlaLysGlyLeuPheAlaA : 124
  36. ||||||||||||||| !!||||||!.!|
  37. ----------------------------------MetAlaAlaAlaLysCysLeuPheValA
  38. 325 : ----------------------------------ATGGCTGCAGCCAAATGTCTGTTTGTTG : 351
  39.  
  40. 125 : spValProArgLysArgThrGlyPheProAsnValThrArgAlaProAspSerSerGlnSer : 144
  41. ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||! !|||||||||||| !::!:!!
  42. spValProArgLysArgThrGlyPheProAsnValThrMetAlaProAspSerHisArgAla
  43. 352 : ATGTTCCTCGTAAGCGCACAGGGTTTCCAAATGTAACAATGGCTCCAGATTCTCATAGAGCC : 411
  44.  
  45. 145 : HisThrGly--IleAsnGlnAspProValThrGlnSerIleLeuAsnGluSerIleIleGlu : 164
  46. !..!##!!:
  47. SerAspSer##Met------------------------------------------------
  48. 412 : TCAGACTCTTAATG------------------------------------------------ : 428
  49.  
  50. 165 : ProGlnAlaLeuAsnGluValAspAspAlaGlyGluGlnSerThrAlaHisSerGlnSerGl : 185
  51. :!!! !||| !||||||||||||!!
  52. ------------------------------------Lys***ThrMetHisSerGlnSerAs
  53. 429 : ------------------------------------AAGTAGACGATGCACAGCCAGTCAGA : 452
  54.  
  55. 186 : uAspSerGluAsnGluLeuProAsnSerLeuSerGlnHisSerAsnArgSerThrGluArgP : 206
  56. :|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||.
  57. pAspSerGluAsnGluLeuProAsn------------------------SerThrGluArgL
  58. 453 : TGACAGCGAGAATGAACTGCCTAAC------------------------TCCACAGAGAGGC : 491
  59.  
  60. 207 : heLeuHisGlnLeuLysGluGluAsnSerGluLeuIleAsnGlnLeuTrpThrAspIleGln : 226
  61. !!||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  62. euLeuHisGlnLeuLysGluGluAsnSerGluLeuIleAsnGlnLeuTrpThrAspIleGln
  63. 492 : TTCTTCACCAACTAAAGGAAGAGAATTCTGAGTTAATCAATCAATTGTGGACTGATATTCAG : 551
  64.  
  65. 227 : GlnLysIleAlaThrGlnSerGlnArgThrProProGlySerProSerSerGluLeuSerAl : 247
  66. |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  67. GlnLysIleAlaThrGlnSerGlnArgThr------------------------LeuSerAr
  68. 552 : CAGAAAATAGCTACCCAGTCACAGAGAACG------------------------CTGTCAAG : 590
  69.  
  70. 248 : aGluAspGlnLysAlaAlaLeuAsnAlaThrAspAlaValLysArgIleGlnAlaGlyProG : 268
  71. !|||
  72. gGlu----------------------------------------------------------
  73. 591 : AGAA---------------------------------------------------------- : 596
  74.  
  75. 269 : lnProGluGluAlaAlaGluProValAspPheSerSerSerTyrLeuGlyGlnValLeuAsn : 288
  76. ||| |||||| !|||
  77. --------------------------------------SerArgLeuGlyPheSerLeu---
  78. 597 : --------------------------------------TCCAGGCTGGGCTTCAGCCTG--- : 617
  79.  
  80. 289 : ThrArgLysGlnLysProLeuLeuAlaLysValLysArgLysGlnAspMetHisAlaAlaSe : 309
  81. !:! !||||||::!||||||||| ||| !||||||!.!||| !!||
  82. ------------ArgSerLeuLeuSerLysValLys---LysThrAspMetArgAlaProSe
  83. 618 : ------------AGGAGTCTGCTGAGTAAAGTGAAA---AAAACAGATATGCGTGCTCCTTC : 662
  84.  
  85. 310 : rLysGlnLysThrAsnMetLeuSerSerSerThrAlaSerAlaAspArgProSerSerThrG : 330
  86. ||||||||||! !||||||||||||:!!||||||.!!||| !||| !|||||||||!.!
  87. rLysGlnLysLysAsnMetLeuSerAlaSerThrThrSerLysAspLeuProSerSerAsnT
  88. 663 : CAAGCAGAAGAAAAACATGTTATCTGCCAGCACAACCTCCAAAGACTTACCAAGTAGCAACA : 725
  89.  
  90. 331 : lySerSerLeuAspValLeuLysHisValIleHisGluValGluHisGluMetGluGluTyr : 350
  91. !!!!|||||||||:!!|||||||||:!!|||:!!! !||||||||||||||||||||||||
  92. hrCysSerLeuAspIleLeuLysHisMetIleAsnAlaValGluHisGluMetGluGluTyr
  93. 726 : CCTGCAGCCTGGATATCCTCAAACACATGATAAATGCAGTGGAACATGAAATGGAGGAGTAT : 785
  94.  
  95. 351 : GluArgCysThrGlyArgGluValThrGlyLeuGlnGlyGlyGlnGlyLeuThrGlyPheTh : 371
  96. ||||||!! |||||||||||||||! !|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  97. GluArgTrpThrGlyArgGluValLysGlyLeuGlnGlyGlyGlnGlyLeuThrGlyPheTh
  98. 786 : GAGCGCTGGACGGGGCGTGAGGTCAAGGGGCTGCAGGGTGGCCAGGGCCTCACAGGCTTCAC : 848
  99.  
  100. 372 : rLeuSerLeuValSerSerLeuCysArgLeuValArgTyrLeuLysGluSerGluIleGlnL : 392
  101. ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  102. rLeuSerLeuValSerSerLeuCysArgLeuValArgTyrLeuLysGluSerGluIleGlnL
  103. 849 : CCTGTCGCTGGTGAGCTCTCTCTGCCGCCTGGTTCGGTACCTTAAGGAGAGTGAGATTCAAC : 911
  104.  
  105. 393 : euArgLysGluValGluThrArgGlnGlnLeuGluGlnMetLeuGlyAspHisArgGluLeu : 412
  106. ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  107. euArgLysGluValGluThrArgGlnGlnLeuGluGlnMetLeuGlyAspHisArgGluLeu
  108. 912 : TGCGGAAAGAAGTAGAGACAAGGCAGCAGCTGGAACAGATGTTAGGTGATCACCGAGAGCTC : 971
  109.  
  110. 413 : IleAspAlaLeuThrAlaGluIleLeuSer-LeuArgGluGluAsnSerThrMetGlnAlaA : 433
  111. |||||||||||||||||||||||| !|||#||||||||||||:!!||||||! !|||||||
  112. IleAspAlaLeuThrAlaGluIleThrSer#LeuArgGluGluHisSerThrThrGlnAlaA
  113. 972 : ATCGATGCTCTGACAGCTGAAATTACTTCTCCTCAGAGAAGAACATAGTACCACGCAGGCGA : 1035
  114.  
  115. 434 : rgLeuGlnGlnTyrMetValThrThrAspGluGlnLeuIleSerLeuThrHisAlaIleLys : 453
  116. ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  117. rgLeuGlnGlnTyrMetValThrThrAspGluGlnLeuIleSerLeuThrHisAlaIleLys
  118. 1036 : GACTTCAGCAGTACATGGTCACTACAGATGAGCAGCTTATATCGCTCACACATGCCATTAAG : 1095
  119.  
  120. 454 : AsnCysProValIleAsnAsnSerArgGlnGluSerGlnAlaProGluArgAlaAlaMetGl : 474
  121. |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| !!|||||||||||||||||
  122. AsnCysProValIleAsnAsnSerArgGlnGluSerGlnAlaSerGluArgAlaAlaMetGl
  123. 1096 : AACTGTCCTGTGATAAATAACTCCAGACAAGAGAGTCAAGCATCAGAACGGGCAGCTATGGG : 1158
  124.  
  125. 475 : yArgArgLeuValAspAsnValGluGlyProValIleSerSerAsnGlySerMetProLeuM : 495
  126. ||||||||||:!!||||||||||||! !||||||:!!|||||||||! !|||||||||||||
  127. yArgArgLeuIleAspAsnValGluValProValValSerSerAsnValSerMetProLeuM
  128. 1159 : TAGAAGACTTATCGATAATGTAGAGGTTCCTGTTGTAAGCAGTAATGTCTCCATGCCATTGA : 1221
  129.  
  130. 496 : etPheArgGlyGluGluValValGluPheProGlnGluGluLeuProValLysLeuSerGln : 515
  131. |||||||||||||||||!.!||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  132. etPheArgGlyGluGluAlaValGluPheProGlnGluGluLeuProValLysLeuSerGln
  133. 1222 : TGTTCCGAGGGGAAGAAGCCGTTGAATTTCCACAGGAAGAGTTGCCTGTTAAACTATCTCAG : 1281
  134.  
  135. 516 : GlyProThrProThrGluAsnLeuAsnLeuAlaAsnAsnPheProThrHisIle-PheGluP : 536
  136. ||||||.!!||||||||||||||||||||||||||||||||||||.!!||||||#|||||||
  137. GlyProAlaProThrGluAsnLeuAsnLeuAlaAsnAsnPheProAlaHisIle#PheGluP
  138. 1282 : GGGCCGGCCCCCACAGAGAACTTGAATCTGGCCAATAATTTCCCAGCACATATTTTTTGAGC : 1345
  139.  
  140. 537 : roAlaValMetLeuThrProProArgGlnLysSerAsnSerGluPheSerProLeuGlnAsp : 556
  141. ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  142. roAlaValMetLeuThrProProArgGlnLysSerAsnSerGluPheSerProLeuGlnAsp
  143. 1346 : CAGCTGTGATGTTAACACCACCCAGGCAGAAGAGCAACTCGGAATTCTCTCCTCTACAGGAT : 1405
  144.  
  145. 557 : --ValLeuArgArgThrValGlnThrArgProAlaProArgIleProProThrValGluVal : 576
  146. ## ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  147. ##------ArgArgThrValGlnThrArgProAlaProArgIleProProThrValGluVal
  148. 1406 : TG------AGGAGAACTGTTCAGACTCGTCCTGCTCCACGAATCCCTCCCACTGTGGAAGTC : 1461
  149.  
  150. 577 : Ile--GluLysGluGlnAsnTrpGluLysLysAlaLeuProIleAspProAspIleGlnAsn : 596
  151. |||##|||
  152. Ile##Glu------------------------------------------------------
  153. 1462 : ATAGAGAA------------------------------------------------------ : 1472
  154.  
  155. 597 : SerSerGluGluAsnArgLeuPheThrGlnArgTrpArgValSerHisMetGlyGluAspLe : 617
  156.  
  157. --------------------------------------------------------------
  158. 1473 : -------------------------------------------------------------- : 1472
  159.  
  160. 618 : uGluAsnLysGlyGlnProAlaPheValSerLeuSerGlnProProCysSerSerLeuProS : 638
  161.  
  162. --------------------------------------------------------------
  163. 1473 : -------------------------------------------------------------- : 1472
  164.  
  165. 639 : erThrGlnGlnProArgAsnProValLeuSerGluGluProThrValLeuGlyAspGlyGln : 658
  166. |||||| !!|||!..||||||!!!|||||||||||| !!||||||||||||||||||
  167. -----GlnGlnSerArgThrProValPheSerGluGluProProValLeuGlyAspGlyGln
  168. 1473 : -----CAGCAATCAAGAACACCTGTGTTCTCAGAAGAGCCCCCAGTGCTTGGAGATGGGCAG : 1526
  169.  
  170. 659 : GlnLeuArgThrSerGluAlaLeuValGlnArgLysAspIleMetAlaArgIleAlaGluLe : 679
  171. ||||||||||||!:!||||||:!!|||||||||||||||||||||.!!||||||||||||||
  172. GlnLeuArgThrAsnGluAlaIleValGlnArgLysAspIleMetThrArgIleAlaGluLe
  173. 1527 : CAGCTTAGAACAAATGAGGCAATAGTACAAAGGAAGGACATAATGACACGGATTGCTGAGTT : 1589
  174.  
  175. 680 : uThrLeuGlnAsnSerAlaIleLysAlaHisLeuAsnAsnIleThrSerSerGlyGlyGluG : 700
  176. |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..!.!!|||! !|||||||
  177. uThrLeuGlnAsnSerAlaIleLysAlaHisLeuAsnAsnIleValGlySerValGlyGluG
  178. 1590 : GACATTGCAGAATTCAGCCATCAAGGCACACCTGAATAATATTGTCGGGTCAGTGGGAGAAC : 1652
  179.  
  180. 701 : lnGlyAspGlyLeuArgGluProArgLysGlnGlySerAlaSerGluValSerThrAsnPhe : 720
  181. |||||||||||||||||||||||!!!||||||||||||||| !!!!::!!:!!.!! !|||
  182. lnGlyAspGlyLeuArgGluProSerLysGlnGlySerAlaArgAspLeuAlaAlaAlaPhe
  183. 1653 : AAGGGGATGGACTTCGGGAGCCAAGCAAACAGGGAAGTGCCCGTGACCTGGCTGCTGCTTTT : 1712
  184.  
  185. 721 : ProAlaValGlnSerLeuThrProSerSerMetGluGluArgIleAlaGluLeuAsnArgGl : 741
  186. |||!.!|||||||||! !.!!|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  187. ProValValGlnSerProAlaProSerSerMetGluGluArgIleAlaGluLeuAsnArgGl
  188. 1713 : CCAGTAGTTCAATCTCCAGCACCAAGTAGCATGGAGGAACGGATTGCAGAGTTGAACCGACA : 1775
  189.  
  190. 742 : nSerMetGluAlaArgSerLysLeuLeuGlnLeuIleGluGlnGlnLysLeuValGlyLeuA : 762
  191. ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  192. nSerMetGluAlaArgSerLysLeuLeuGlnLeuIleGluGlnGlnLysLeuValGlyLeuA
  193. 1776 : GAGCATGGAGGCTCGCAGCAAACTGCTCCAGCTGATAGAGCAGCAGAAACTTGTTGGTTTGA : 1838
  194.  
  195. 763 : snLeuSerSerSerProValSerProValGluSerProLeuArgAlaTrpAlaGluGluGly : 782
  196. |||||||||||||||||||||||||||||:!!||||||||||||||||||||||||||||||
  197. snLeuSerSerSerProValSerProValGlnSerProLeuArgAlaTrpAlaGluGluGly
  198. 1839 : ACCTTTCCTCTTCACCAGTGTCACCTGTTCAGTCCCCTCTCAGAGCATGGGCCGAAGAAGGA : 1898
  199.  
  200. 783 : LysArgThrIleGluValSerValProGlyMetGluAlaSerGluSerSerLysCysAsnTh : 803
  201. |||||||||||||||||||||||||||!.!|||||||||||||||!:!||||||||||||||
  202. LysArgThrIleGluValSerValProAlaMetGluAlaSerGluAsnSerLysCysAsnTh
  203. 1899 : AAGCGAACCATCGAGGTATCTGTTCCAGCAATGGAGGCTTCAGAGAATTCGAAATGCAATAC : 1961
  204.  
  205. 804 : rValSerProValSerGlyAsnSerSerArgArgSerSerGlyAlaIleSerAsnSerCysS : 824
  206. |:!!|||||||||||||||! !||||||||||||||||||||||||! !|||||||||||||
  207. rIleSerProValSerGlyIleSerSerArgArgSerSerGlyAlaThrSerAsnSerCysS
  208. 1962 : CATCTCTCCTGTCAGCGGGATCAGTTCAAGAAGGTCTTCAGGGGCTACTAGCAATTCTTGTT : 2024
  209.  
  210. 825 : erProLeuAsnAlaThrSerGlySerGlyLysPheThrProValAsnProArgThrLysThr : 844
  211. |||||||||||||||||||||||||||||::!||||||||||||||||||||||||||||||
  212. erProLeuAsnAlaThrSerGlySerGlyArgPheThrProValAsnProArgThrLysThr
  213. 2025 : CTCCACTAAATGCCACCTCGGGAAGTGGACGATTCACGCCTGTTAATCCAAGAACAAAGACT : 2084
  214.  
  215. 845 : GluLysLysAsnGluGluGlyTrpPheAlaLeuSerAlaHisIlePro : 860
  216. ||||||:!!|||||||||||||||||||||||||||.!!|||!!: !!
  217. GluLysGlnAsnGluGluGlyTrpPheAlaLeuSerThrHisMetSer
  218. 2085 : GAAAAGCAAAATGAAGAAGGCTGGTTTGCGCTTTCTACCCACATGTCA : 2134
  219.  
  220. vulgar: NM_144550.4 0 860 . RAP32000.1 54 2134 + 1293 M 89 267 F 0 2 G 25 0 M 33 99 F 0 2 M 1 3 G 28 0 M 17 51 G 8 0 M 35 105 G 8 0 M 4 12 G 32 0 M 7 21 G 5 0 M 8 24 G 1 0 M 121 363 F 0 1 M 111 333 F 0 1 M 23 69 F 0 2 G 2 0 M 19 57 F 0 2 M 1 3 G 61 0 M 221 663
  221. >RAP32010.1 (54 - 2134)
  222. ATGTCATTGATCAGAGTGAATCGCTTTGGTTCCCGGGGAGGTGGAAGAAAAACTCTGAAAGTAAAGAAGA
  223. AAGCTTCAGTGAGGCAAGAATGGGATAATACTGTGAATGATCTAACAGTGCATCGGGCAACTCCTGAAGA
  224. TCTGGTCCGCCGTCATGAGATACACAAGTCAAAGAATAGAGCATTGGTGCACTGGGAGCTTCAAGAAAAA
  225. GCTTTGAAGAGAAAATGGAAGAAGCAGAAACCAGAAGCTGCAAGTCTTGAAAAAAGAAGATGGCTGCAGC
  226. CAAATGTCTGTTTGTTGATGTTCCTCGTAAGCGCACAGGGTTTCCAAATGTAACAATGGCTCCAGATTCT
  227. CATAGAGCCTCAGACTCTTAATGAAGTAGACGATGCACAGCCAGTCAGATGACAGCGAGAATGAACTGCC
  228. TAACTCCACAGAGAGGCTTCTTCACCAACTAAAGGAAGAGAATTCTGAGTTAATCAATCAATTGTGGACT
  229. GATATTCAGCAGAAAATAGCTACCCAGTCACAGAGAACGCTGTCAAGAGAATCCAGGCTGGGCTTCAGCC
  230. TGAGGAGTCTGCTGAGTAAAGTGAAAAAAACAGATATGCGTGCTCCTTCCAAGCAGAAGAAAAACATGTT
  231. ATCTGCCAGCACAACCTCCAAAGACTTACCAAGTAGCAACACCTGCAGCCTGGATATCCTCAAACACATG
  232. ATAAATGCAGTGGAACATGAAATGGAGGAGTATGAGCGCTGGACGGGGCGTGAGGTCAAGGGGCTGCAGG
  233. GTGGCCAGGGCCTCACAGGCTTCACCCTGTCGCTGGTGAGCTCTCTCTGCCGCCTGGTTCGGTACCTTAA
  234. GGAGAGTGAGATTCAACTGCGGAAAGAAGTAGAGACAAGGCAGCAGCTGGAACAGATGTTAGGTGATCAC
  235. CGAGAGCTCATCGATGCTCTGACAGCTGAAATTACTTCTCCTCAGAGAAGAACATAGTACCACGCAGGCG
  236. AGACTTCAGCAGTACATGGTCACTACAGATGAGCAGCTTATATCGCTCACACATGCCATTAAGAACTGTC
  237. CTGTGATAAATAACTCCAGACAAGAGAGTCAAGCATCAGAACGGGCAGCTATGGGTAGAAGACTTATCGA
  238. TAATGTAGAGGTTCCTGTTGTAAGCAGTAATGTCTCCATGCCATTGATGTTCCGAGGGGAAGAAGCCGTT
  239. GAATTTCCACAGGAAGAGTTGCCTGTTAAACTATCTCAGGGGCCGGCCCCCACAGAGAACTTGAATCTGG
  240. CCAATAATTTCCCAGCACATATTTTTTGAGCCAGCTGTGATGTTAACACCACCCAGGCAGAAGAGCAACT
  241. CGGAATTCTCTCCTCTACAGGATTGAGGAGAACTGTTCAGACTCGTCCTGCTCCACGAATCCCTCCCACT
  242. GTGGAAGTCATAGAGAACAGCAATCAAGAACACCTGTGTTCTCAGAAGAGCCCCCAGTGCTTGGAGATGG
  243. GCAGCAGCTTAGAACAAATGAGGCAATAGTACAAAGGAAGGACATAATGACACGGATTGCTGAGTTGACA
  244. TTGCAGAATTCAGCCATCAAGGCACACCTGAATAATATTGTCGGGTCAGTGGGAGAACAAGGGGATGGAC
  245. TTCGGGAGCCAAGCAAACAGGGAAGTGCCCGTGACCTGGCTGCTGCTTTTCCAGTAGTTCAATCTCCAGC
  246. ACCAAGTAGCATGGAGGAACGGATTGCAGAGTTGAACCGACAGAGCATGGAGGCTCGCAGCAAACTGCTC
  247. CAGCTGATAGAGCAGCAGAAACTTGTTGGTTTGAACCTTTCCTCTTCACCAGTGTCACCTGTTCAGTCCC
  248. CTCTCAGAGCATGGGCCGAAGAAGGAAAGCGAACCATCGAGGTATCTGTTCCAGCAATGGAGGCTTCAGA
  249. GAATTCGAAATGCAATACCATCTCTCCTGTCAGCGGGATCAGTTCAAGAAGGTCTTCAGGGGCTACTAGC
  250. AATTCTTGTTCTCCACTAAATGCCACCTCGGGAAGTGGACGATTCACGCCTGTTAATCCAAGAACAAAGA
  251. CTGAAAAGCAAAATGAAGAAGGCTGGTTTGCGCTTTCTACCCACATGTCA
  252.  
  253. -- completed exonerate analysis
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