public static void main(String[] args) {

        Scanner s = new Scanner(System.in);

        ArrayList<Integer> notas = new ArrayList<>();

        System.out.println("Entre com notas de 0 a 10");
        int num = 0; // criei essa variavel para fazer as instruçoes ficarem em loop ate o usuario digitar o -1

        while(num != -1){

            notas.add(s.nextInt()); //aqui armazena o primeiro valor digitado

            if(s.nextInt() == -1){ // nesta linha eu sei que que esta pegando o segundo valor digitado e se caso ele seja -1, atribuo o valor -1 a num, saindo assim do loop
                num = -1;
            }else{ //caso o valor nao seja -1 vai adicionar no ArrayList
                notas.add(s.nextInt()); //aqui esta o problema, eu nao consigo adicionar o valor anterior que foi comparado no if
                }
        }

        System.out.println(notas.toString());

    }

Scanner s = new Scanner(System.in);
ArrayList<Integer> notas = new ArrayList<>();
System.out.println("Entre com notas de 0 a 10");
while (num != -1) {
    int num = s.nextInt() //armazena em variável para poder usar onde quiser
    if (num != -1) {
        notas.add(num);
    }
}
System.out.println(notas.toString());

int temp = s.nextInt();
if(temp == -1){
   num = -1;
}else{ //caso o valor nao seja -1 vai adicionar no ArrayList
  notas.add(temp); //pega o ultimo valor digitado
}