Синтетическая биология - область знания направленная на создание новых систем на основе живых организмов, а также совершенно новых организмов.

Синтетическая биология это следующий шаг генной инженерии - от перемещения нескольких генов между организмами к созданию системного подхода для разработки биосистем.

Полезные сайты:

http://syntheticbiology.org/ - общий сайт-каталог.

http://partsregistry.org/Main_Page - невероятно крутая штука. Это - база данных стандартных биологических деталей (последовательностей генокода которые кодируют разннобразные объекты), которые можно внедрить в целевой организм (как правило бактерию, часто E.Coli) для того чтобы он получил новую функцию.

http://openwetware.org/wiki/Main_Page - содержит вики с релевантными статьями и протоколами.

http://www.biopunk.org/science-f3.html - форум людей из DIYbio движения, которое цветёт на западе (оно заслуживает отдельного обсуждения, это слишком важно чтобы упоминать о таком мимолётом).

Их гугл-группа: https://groups.google.com/forum/?fromgroups#!forum/diybio

http://molbiol.ru/ - самый большой российский форум по молекулярной биологии, содержит последние новости, кучу разделов. Что интересно так этот то что многие его пользователи работают за границей (русские учёные везде есть). Полезно его читать.

Теперь к литературе:

Для начала нужно прочитать энное количество статей в википедии, лучше всего английской (русская хуже - статьи не так подробны). Темы - Клетки (прокариоты-эукариоты), молекулярная биология, основные биомолекулы - белки и ДНК, простейшая биохимия - роль АТФ как энергетического носителя в клетке.

http://en.wikipedia.org/wiki/Cell_(biology)
http://en.wikipedia.org/wiki/Metabolism
http://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_biology
http://en.wikipedia.org/wiki/DNA
http://en.wikipedia.org/wiki/RNA
http://en.wikipedia.org/wiki/Protein
http://en.wikipedia.org/wiki/Transcription_(genetics)
http://en.wikipedia.org/wiki/Translation_(biology)
http://en.wikipedia.org/wiki/Ribosome

Также есть очень хорошая вводная книга в молекулярную биологию, написанная понятно и полная прекрасных (и достоверных) иллюстраций - "The machinery of Life" http://libgen.info/view.php?id=250894

Начав представлять как работают клетки хорошо бы прочитать вот этот файл - "Букварь синтетического биолога" http://openwetware.org/images/3/3d/SB_Primer_100707.pdf
Там всего 74 страниц, но описаны многие необходимые вещи.

Далее. Есть хороший онлайн-журнал "биомолекула", который написан понятным языком но при этом без компромиссов со стороны научности. Т.е. там детализированные статьи с разъяснением терминологии где это требуется.

http://biomolecula.ru/

Этот журнал желательно прочитать целиком (конечно не сразу - за несколько недель), разобраться в терминологии (там перед каждой статьёй список новых терминов), если что-то непонятно или интересно - искать в google.

Также полезно читать биологические статьи на http://elementy.ru/ , он тоже пока не стал попсовым.

Теперь к более серьёзной литературе, учебникам.

* Общая биология: Грин http://rutracker.org/forum/viewtopic.php?t=2173472
* Молекулярная биология (упрощённый вариант): Альбертс, Essential Cell Biology http://libgen.info/view.php?id=911397
* Молекулярная биология: Альбертс, Molecular Biology of the Cell http://libgen.info/view.php?id=596018

Альбертса можно найти и на русском на торрентах. если нужно.

По белкам:

Есть хороший курс по физике белка http://phys.protres.ru/lectures/protein_physics/
Также полезно читать обзоры разнообразных белков и механизмов их функционирования:
http://www.rcsb.org/pdb/101/motm_archive.do
http://www.ebi.ac.uk/interpro/potm/archive.html
http://web.expasy.org/spotlight/snapshot/index.shtml

Надеюсь этот текст будет кому-то полезен, дополнение и обсуждение приветствуется (например я биохимию не затронул, хорошо бы если кто-то посоветует хорошую книгу).

Дополнительная литература и ссылки:

сть много хороших вводных статей тут: http://web.archive.org/web/20061210071121/http://journal.issep.rssi.ru/t_cat.php?id=1190

Для программистов есть короткое введение в молекулярную биологию http://www.biostat.wisc.edu/~craven/hunter.pdf

По биоинформатике есть хорошая книга Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids [Richard Durbin, Sean R. Eddy, Anders Krogh, Graeme Mitchison] http://libgen.info/view.php?id=340836
и вот такая книга: Analysis of Genes and Genomes - Richard J. Reece http://libgen.info/view.php?id=462080

Недавно я искал хорошую книгу по устройству E.Coli и нашёл Escherichia coli: Virulence Mechanisms of a Versatile Pathogen http://libgen.info/view.php?id=669159

По белкам есть ещё Bionanotechnology : Lessons from Nature Гудселла, это по сути довольно подробный разбор механизмов функционирование природных белков которые выполняют самые различные функции.

Если хочется получить некоторое представление о работе центральной нервной системы то есть вводная книга "Глаз, мозг, зрение" Хьюбела http://libgen.info/view.php?id=42571

На торрентах в DHT есть здоровенные раздачи с большей частью литературы по биологии и биоинформатике, их можно найти в поисковике http://btdigg.org/

Базы данных: их очень много. Советую посмотреть что из себя представляет GENBANK: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
PDB: http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do
UNIPROT: http://www.uniprot.org/

Также настоятельно рекомендую как можно больше искать в гугле - все названия белков, коды, реакции. Чем больше вы найдёте и прочитаете тем лучше для вас. Со временем вы сами заметите что понимаете читаемые вами статьи всё лучше.
Советую искать интересующие вас научные статьи и читать их. Искать можно и в google и в google scholar.
Когда возникнут проблемы со скачиванием их из-за paywall - sci-hub.org вам в помощь.

И да, этот небольшой текст не претендует на полноту - поиск альтернатив и его расширение приветствуется.
До новых встреч, начинающие генные инженеры!