Exemplo de execução via Java

public class JavaLinuxRun {

    /**
     * @param args
     */
    public static void main(String[] args) {
        // TODO Auto-generated method stub
        JavaLinuxRun jlr = new JavaLinuxRun();
        jlr.addP();

    }

    void addP()
    {
        try {
            String comando = "/usr/bin/xchat";
            System.out.println("Executando " + comando );
            Runtime.getRuntime().exec(comando);
        }catch (Exception e){}
    }

}