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Aceofspades25

HERV-W sequence with embedded ALUY

Feb 23rd, 2015
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  1. >Human HERV-W sequence (HERV17) (With embedded ALU): Chr15
  2. ACTGATAGGATAATAACACTAATAACTTTTTTTTGAGACAGAGTCACAC <- Pre sequence
  3.  
  4. CTGT <- TSR
  5.  
  6. CACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGC <- LTR
  7. CCCCAGGGTTCAAATGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTCGTAGCTAGGAT
  8. TACAGGCACCCACCACCAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC
  9. AGTGTTTTACCATGTTGGGCAGGCTGGTATCAAACTCCTGATCTCGTGAT
  10. CCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTAAGGCGTGAGCCA
  11.  
  12. CCATGCCCAGCCAACAATAGTAATTTTAAATTTTATTTTGATTTCCTCATT <- HERV-W (HERV17)
  13. CTCCTCTGACTCCACATCTTCTCCTTGGGTAATTCCACCCATTCCTGTGA
  14. CGTTGACTATCATCGTCCCTGATACCTCAATGCCAAGAACTGACTTGACT
  15. GAAAGATACCCCGTCGATATAGTAAATTTATTATGAGGGGTGGGGACAAT
  16. CTAGCAGACTTTTGGTTGTGGCCCTTCCTAGTCATACGGTTTGATTTGCA
  17. TACATGCCCTAGGGAAAAGGACATGTGAAGAAAAACTTGGGCCTTGGCCC
  18. AAGGCTCTGGGTGGTGGAAACTCTATTACCAGGACAATTAGATAGATTTG
  19. TCTCTGCTACACTTTGGGGGTGGCCCTGGGCAGAGGGAGAAGAACTCACT
  20. CTTAGATAAAAGGTGTCAGTAGCCATGGTGACCCACCAGGACGAGCCTGA
  21. GAAAGTGGTCCAGTGTCTGGGTTATTGAGTGGCTATTCCCAGACACAAAG
  22. TTAAGAGATCTGGACATTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
  23. GCCGTTACAAGATTTAAGAGAGTGAAAACAGATCTCCCATACAAAGGGAG
  24. GGGACCCAAAGAGGGTAGCCGTTGCCGGCTTGAATGCCTGGGTTTATATC
  25. CCGATCATTGTCCCTCCCCCATGCCCTCAGACGATAGATGATTGGCTATT
  26. TCTTAACCTCCTGTTTTTGCCTAATTAGCATTTTAGTGAGCTCTCTTTAC
  27. TACCTGATTGGTTGGATGTGAGCTAAGTTACAAGCCCCATGTTTAAAGGT
  28. GGATACGGTCACCTTCCCAGCTAGGCTTAGGGATACTTAGTCAGCCTAGG
  29. AAATCCAGCTAGTCCTGTCTGTCAGTCCCCCCTCTCAACAGGAAAACCCA
  30. AGTGCTGTTGGGGAGGTTGGCCGATATCCACTCTAACTGCTTCCTGCTGA
  31. ATTGGGGCATAGTAGGGGTTATGCAGTTGAGATTTCCTCGGGAGGGATGC
  32. CTTTGATGTCATTAACACCAGAGCATGGGCTCCAGGCTGGTCCAGGGGTC
  33. CGCAGTAGATCTTAGTCATGGACTGCTTCTGGGGCTCCAATTGAAGAACC
  34. ATTTGTAGTTTTACAGCTTTGATTCTGGAAGAAGCAAACTTAACAAGGAG
  35. GTTAAAGATACAGGCATTGAAATGTATGGCCTGCAGTGTAGGGGATTATT
  36. TCTTTGGCACACTTCACAGGCCCTGACTATCTGCTTGACAGTTTTGAAAA
  37. GACCTAGTCCAGTAAATAATGATTTGGCCATCTGATGGGTGCTATCAATG
  38. CCTAAGTGAAAGGTTTGGTGAAGGGTTTTAAGTAAGGTTCCATTGGTTAG
  39. CTGCAGGCAAAAGTATTTTTCCTTCTTCGGTGGCTAGCCATCCTGAGGGG
  40. AGGAAACTACGTCCTCATGAGGTTCCCCATTCTATTTATTCTGCTGAGTA
  41. CTGGGGCTTGGTTTCCCAGAGGGGATTACCCCATACTAGGGGTCCTTCTA
  42. TAAACATTTCTAATGGAGGGTCCCACTTTGTGGCTCTTTTGGCAGTTCCC
  43. TTCTATTTCCCTTTCCTTTCCTTTCTGATGACCCCAGCAGTGTAAGACTG
  44. CCTCCTCTTTAGGTTTCTATACAGCCAATAATAATAACCTCCTAATGGCT
  45. TCCTGATGTTTGATAGGTGTTCCCTCGGAAGTTAGGAGTTCCCTTTCTCT
  46. CCATATTGCTGCGTGGACGTGGAGGACTAGGTAAGCATACTCAGAGTCTG
  47. TATATATACTTACCTTTTTTCCTTCTAATTCTAGTGCCCGAGTGAGGGCT
  48. ATTAGTTCTGCCAGCTGAGCGCTAGTTCCTGGAGTGAGAGGATTACTTTC
  49. AAGTATTCCATTATTACTGACCACTGCATACCCCACTTTTCCAAGTCCTT
  50. TTTCTACAAAGGAACTCCCATCAGTATACAAGTTGAGGTCAGGATCAGTC
  51. AAGGGAACCTCTAGAAGTTCCCCTCGAGTGGTGTAGGTTTGAGCAATCAC
  52. CTGTTGACAGTTATGTTCTATCTTTTCTTCATTGTCTGGAAGAAATGTTC
  53. CTGGGTT
  54.  
  55. AAGAGTTGCACAAGTGCA <- ALUY TSR
  56.  
  57. GGCCACGCACAGTCGCTTATGCCTG
  58. TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAAAGGCAGGCAGATCACAAGGTCAGGAG <- ALUY
  59. ATCTAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATA
  60. CGAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCGTGTAGTCCCGGCTACTTG
  61. GGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGT
  62. GAGCCAAGATCGTGTCACTGCGCTCCAGCCTGGGTGACAGAGCTAGATTC
  63. TGTCTCAAAAAAAAAAAAAA
  64.  
  65. AAGAGTTGCACAAGTGCA <- ALUY TSR
  66.  
  67. CAGTCGCAGCAC
  68. TGGCCCTTCAAGTAATAGAGCCTGATATTTAAGCAAATGGTTGTCTGACA <- HERV-W (HERV17) (Continued)
  69. GCCACAAGTCTCCTTTAGCAGTGAGTATATCATTTACATCATGCGATGTC
  70. CACACAGTAAGATCTCTTCCCTGTATTATTTTAACTGCTTCGGATACTAA
  71. GATTGCTACTGCTGCCACTACCCAAAAACAGTGAGGCCAACTCTTTGCCA
  72. CTCCATCAATTTCCTTACTCAGGTGTGCCATGGGTTGCAAGCTGGTCCCT
  73. CGGACCTGTGTAAGGACTCCTAGAGCTATTCCTGTTTTTTCTGTGACATA
  74. TAAAGAAAAGTCTTGCCCCATTGGCAAGCTTAATGCTAGGGCTTGGGTTA
  75. GGGCCTGGAAAGCCGCTTCTGCTTCAGGTGTCCATCTTACTAAATGGGTA
  76. TAGGTTGTCTGAGTTTCCATAATTAGTGTATATAATGGCCTGGCTATTTC
  77. ACTGTGCCTGGGAATCCATATTCGGCAGAAGCCTGTTATGCCAAGGAACC
  78. CTCTTAGTTGCTTTAGGGTTTTGGGATGAGGATAAGCCAGTATAGGCTGG
  79. AAACGTTCCTCACTGAGGGCCCTGGTGCCTTTGGATAATTTTAGCCCTAA
  80. GTATTTAACCTGCTGTGAGCAGAGCTGAGCCTTTGGTTTGGAAACCTTGT
  81. GGCCACAGGTAGCGAGGAAATTTAAGAGCGCTTGGGTGGCTTGATGGCAC
  82. AAGGTTTTTGAACGGGCAGCTAAAAATAAATCATCCATGTACCGAAGGAC
  83. AAGAGTGTCCAGGTATGAGAACTGGCTCAAGTCTTGGGCTAGTGCCTGGC
  84. CAAATAGATGGGGGCTATCCCTGAACCCTTGGGGTAAAACAGTCCAGGTG
  85. AGTTGAGACATTAGGTTCGAAGGATCTTCAAAGGCAAACAAGAATTGAGA
  86. GTCAGGATGTACAGGGATGCAGAAAAAGGTATCCTTAAGGTCCAGGACTG
  87. TAAACCACTCTGCTTCCTCTGGTATTTAGGAAAGCAGAGTATAAGGGTTA
  88. GGTACAACTGGGTATAGAGGGACAATGGCCTCATTGATAATCCTGAGATC
  89. TTGCACTAACCTCCACTGTCCATTGGGTTTCTGTACTCCTAAAACTGGAG
  90. TATTGCAGGAGGTATTCCATGGTTTTACTAGGCCTTGGGCTTTTAGGTCC
  91. TTAACAATCTTTTGGAGTCCTTGTTGGGCCTCGGGTCTAAGGGGGTACTG
  92. CCTTTGGTAGGGAAAGGAGGTGGAATTATTTAACTTGAACAGGATGGGCA
  93. TTCTTTGCTCATCCACATTGCCCTTCTGTTGCCCAGACTTCAGGATTAAT
  94. TCCTTCCTCAAGCAGGGGACAACAAATGGGTGTTCCTTCTCCTATATTCA
  95. GGTGTATAATGGCCCCTGCTTTTGCTAGAATGTCTCTCCCTAACAAGGGA
  96. GTGGGGCTTTCAGGCATAATTAGAAAAGCATGTGAAAAGAATAAAGTTTC
  97. CCCAGTCACAACTTAGTGGCTGGGAGAAGTATCTAGTGACTGGCTGTCCT
  98. AGGACCCCTTGGATAGTGACAGATCTGGAGGACAGTTGTCCGGGACAGGA
  99. GAGTAAGACTGAGAAGGCCGGTTCAGTGTCCAGGAGACAGTTAACCTCCT
  100. GGCCCTCAATGATCAAGCATACCCAGGGCTCTGTGAGGGTGATGGCATGG
  101. GCTGGTGCTTGCCCCGGGCACCCTCTGTCCTGCTGCTGGATCATCTGGTT
  102. AGTGGCTTCTGACTCAGAGGACCTTCGTCCCCTGGGACAGTGGGCCTTCC
  103. AGTGATTCCCTTGACATAAGGGGCATGGACGAGGGGGCAGATTATTTCTA
  104. TTCGGACAATCTTTTTTAAAGTGTCCTTGTAGACCACACTGGAAGCAAGC
  105. CCTATTAGGCATTTGATTTGCCCAGCTTTTCCCTTTCCCAGAGCCTCCAA
  106. AGTCCGCTTGCCTGAGGGTCATGACTAAAGTGGTGGCCTTTTGTTTTAAT
  107. CCTGTTTGTCCCATTCCGCCTGCTCCTCCTGATCTCTATTATAAAAAACC
  108. AAGGTTGCCAAGTGCAATAGGGTTTCTAAGTTTTGCTCCGGGCCTAAGGC
  109. GGACTTTTGAAGTTTTTTTCTAATGTCTGTAGCTGACTGAGTGATACACT
  110. TATCCTTTAGGATTAGTTGGCCTTCAGTAGAGTCAGGTGACAGAGAGGTA
  111. TGCTTCCTCAGTGCCTCCCTTAGTCTCTCCAGAAAGGCAGTAGGATTTTC
  112. TTCCTTTCTCTGTGTTATAATGGACATCATTGAATAATTCATAGGCTTCT
  113. TCCTAGTTTTCCTTAGTCCTTCTAGCACGCAAGTTAGCAAATGTCTGAGG
  114. CACCAATCTCCATGTTCTGATTTTGCATCCCAGTGAGGGTCTACACTGAG
  115. AACTGCCTGCTGGCCTGTGGGGAATTTTTCTCTTTCTTCTGTTGTCATCC
  116. TATCATTGACCTGGCTGAGATACCAGAGATCGCCAAACTCTCAGGCTGCA
  117. GTTATGGCGGCACTTCTCTCATTTGGAGCTAGTGTCTGATTTAGCAGTAA
  118. CATTATATCTCTCCATGTCAGATCAAAGGACTGTCTTAACCCTCGTAAAA
  119. TATCAATATAGCCATCAGGGTTATCAGAGAATTTACCTAGGTCTATTTTA
  120. ATTTGCTTCAAGTCTGAGAAGGAAAAAGGTACATGCATTCTGGCTGGGCT
  121. GAATTCTCCTCCTTCCACTGCTTGGAGGGGGCATAATTGGGGAATATTGG
  122. TACTCTTTGGTTTGTTGTTTACCCCTTTGTCTATCTCCTTTTGGACCGTT
  123. TGGGTTGAAGGGGGATTCTTATTAGTTGGGAAAGGAGTCGGGGTGGGGGG
  124. CCACTGGGGTAGGGAGGTAGACTCTGAGGGCTTCCTGTAGGGCATAAATC
  125. ACACTTTTTACATAATTGCGAGTTGTCTCTTAATGAAAAGAAAGTTTGTA
  126. CATACAGCACTTCACTCCATTTGCCTTCTTTTCTACAAAACAGGTCTAGC
  127. TGTAAGATGGTGTTGTAATTTATACTTCCCTCAGGAGGCCAGGCTTCCCC
  128. CCTTGAAGCGGATATCTGACCAGGCGGTACTGCAGAAGAATATAAGTCGT
  129. TTCTTAGCATCTGAGGGTCAAATTGGTCCCAATTCTCCAGAATACATCTT
  130. AGGGGCGTTTTTGCCTTAGGGGGAATGTTTCCCATCTGAAAAAAGAACAT
  131. AGGAATGCCAGCAGCCCTAGTCATTTTCTGATGAGCATTAGTCCTAGAGC
  132. GTCCTCTGTGGTCCTAATGTTTATTCCTTTCCAGGGTGCGTAACCACCCG
  133. TGGACTTCTGCTTGTCGGATTAGTTACGCTCACCGATGTAGCAGTCCTGC
  134. ACCTGTTTTCCCGCCTTTCTTGACCACAAAGAAAGGGGTGCGGGCTGCTG
  135. GATTCTAGTGGTCCTTTACCAGCATACCCGACATTGCCTTTGTGCTCAGA
  136. GGTGAGTTCTAGAGCTGGGCTGGGTTCTTGAATATTTCATAGCAACCCAG
  137. TTGCCCCATCAAGATGCATTCCCATAAACAACAGTTGTTATGCAAATTCA
  138. CTTCAGAGAGGGTGTAGGTAACCTTTTGAGTCAGGATTGAGATAGAGTTT
  139. TTTGATTCTGTAAGTACTTTAAGGCTTGGCTGAGTCCAAACAACTCTCAC
  140. GTTTGAGCAGAAAAATTATTAGGCAATTCTCCTAACTCTGCTTCCACAAG
  141. AGTCTCCCTATCAGTTACTGAATACCCATTGTGAGTTTTTTTTCAATCAC
  142. CTGGGAGGAACCATCTATCATCCTGTCCTGAAGGGAGTTCCTCCTAGGTC
  143. TGGTCGGATCTTTGTATGGTAATTAAGATTTAAATCCCCTGTTAGGAAAT
  144. TTGCTGGGTTAAGGGAATTTTCAGTGGTTAACGTTAAATCAACTTTTTCT
  145. AACAGAAGAGCCCGATACTTTAAGCTTTTAGTTAGTAAGCTACCTTTTTG
  146. CTTTTTTGACTTAGGATAATTCTGAACTGGTGAGGTGTGCTCACAATGAG
  147. GTTTCCTCTAAAGGTTATTTTTCTACTTTCTTCTGTTAGCAAAGCAGTTG
  148. CTGCTACAGATTGAACGCATTTGGGCCATCCATTGGTTACTGAGTTAAGG
  149. ATTTTTGATAGGAAGGCTACAGGTGGTCAGTGGTCTCAGTGTTTTCAGGC
  150. TACACCCTTGTTTACACTGACAACAAGGTAGTATTGGAGTATTATAGGGT
  151. CACGGAGAAGACCTTCAATTATCAATTATAGGTTTTAAATTTACCCTGGC
  152. TTTTAAAGGATTAGGGCACACTGTTTTTTCTTTACTACTTCTATCTTTCT
  153. CTTTCTCTCTTTGACTCCCTCTTTGTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCCCCTC
  154. TGTCTCTCCCCTCTGTCTCTCTCTGTTTCTCTGTCTTTTCTCCTAGCCCT
  155. TTACAAACTTGGGGCCCTGGCAAGGGTAGAAGGGAATGGGTCCCACATAA
  156. CTGCCCATGTCGAGAGCTGTATGCCTAAATTGGGAGAGACACCAGAGACA
  157. AGATTCTCTGGGTCCATAGCCTAGGGGCCTAAGGACTCAGCGTAGAGCTT
  158. CCTTAGATCCCTTTGGAGATACAACTTGCTAGAGGAAATGAAAGTCTGAA
  159. CCATTAGTACCCAGGAGGCAGGGATCGGAGGAAGTAGATTCAGAGGTAAG
  160. GAGAATTTTGGGGCTACACTTTCAAGAACGTCATGGTCGGATCCAGGAAT
  161. TATGGGTCAGAAGGAAAGGTAGGGGTGAACGCATGGGCGACTGTTGAGTA
  162. GAGACTTCTGGCTGCACCATGATCTCAACCAGCTAACATCGGGAGTTTGG
  163. GACGACAGCTTTTTACCTCTAGTCGGCCCTCTGCTTCCCCGGGAGAATTG
  164. AAAGCGGAAGCTGCTTCAAGGCAGACCAACATACCCAACCCAGAAGGGTT
  165. GGGGGGTTGTTAGAAAGCCCTTTCCCAGACAGCCTCACACCTGAGTCTTA
  166. ATTCTGGCGGCCACGCTAATCATTTTTAACCGGCCAACAGGTGCCCAGTA
  167. TTTTCCTCCAATTCTAAGGAAGGATAAGACAGAATAGCAAGCAAAAGTGG
  168. TCCAATATTACTCAGTGCTTTGGAGATCCCTTCGTGGTTGCCAAAATGTT
  169. ACGGGGAGGTCCTTGCTCCCAGAGGTCCCAAGATGGTGGCGGGCCGCTTC
  170. CAAGATGGCGGCAAGCCTCTTGTTCCCTGACCCGGGGTTCTTGGCCTCAT
  171. GGATTCCAAGGAATGGAACCTTGGGCCATGCAGTGAGTGTTATAGCTCTA
  172. TTAGAAGCCGTGGGTCATGGAAGAGAACCGTGGAACCCAGCGACTAGTGT
  173. TCGGCTCGATTAGGATGAACCCAGGTACTTAGCCGTGCAGGAACAATGGC
  174. AAGCTTTTAGCCCAATCAGGAGCGGCAATGGGCGCCTTGCTGGATCAGGA
  175. GCACAGCGGACGCCCTGCTGGATCCGGAGGGGTGGAAGTCAGTGGTGGGT
  176. CTGCAACAGTGGCAAACAGCAGTGGTGGATGGTGAGAAAAGCTCAGCTTG
  177. AGCAGTAACAAACATGGACCAGAAGAGTGTGCAGTTGCAAGATTTAATAG
  178. ATTGAAAACAGAGCTCCCATACAAAGGGAGGGGACCCAAAGAGGGTAGCC
  179. CGACATTTTCTTTTAACAGAGTTCTGCAGCAGTATAACTGCTCTTAGGGA
  180. GCTCACTAGGAATCCCACTATAAGTGCATGTGGAGAGAGACCTGTGGACA
  181. AGGGATGTGAGTTGTGCTGACAGGTAGGCATGTCAACACTATTGCTGGAG
  182. GCAGCTCTTCAGCACTGTAGTTCCACTCAGGATGCCCCCTGAAGGGCAGG
  183. GGGTGAAGGGAAACCCTCCCAGGGACAGAACTTTGAGCAGGGCACCTGGT
  184. GTTTATCTTGCCTGGAAGAAAAGATAACTAAAGGATTGGATTAGGTCTAT
  185. GTTGATTTATGGACAGAGGCTAATAATTGTTTGGTCAGGGACTTGGAGGA
  186. AATGCAACTGGAAATTTGATGACAGGGAGGTATGGAAAGGAGATATTTAG
  187. ACGGACCTCTCCAAATGGACTCAAAGGTGAAGATATTTGTATTCCAAGTG
  188. AATGCTTAGCAAAGAGCAATCTCAGCAAGCATGATCTTAATAATCAAGTG
  189. GGCAAGATGACCCATTCTGTAAATGTCGGTGGACTCATAAACAGCATTCA
  190. AAACCTCAATTCATGCTATTGTGCCTACAGCTCATATCCAGCATGGAATG
  191. AGGTTTTGCATGGGCCCAGCAACATGGACTTCCATTTATCAAAAGCAATC
  192. TGGTTACAATCACTGCCGAATACCCAACCTACCTACGAATAGCAGAGACC
  193. AACATGGAGCCCCCAACATAGCACTACTCTCTAAAGGGACCAGCCAACAC
  194. CTGGTGGCAGGTTGACTAGGTTGGACCACTTCTAGTGGAGGCAGTAGCCC
  195. TTTTTATCACTGGACTAGATATGTTTTATGGATGTGAGTTTGCCTTCCCT
  196. GCCCACAATGCCCCTGCCCCCATCACCATCCATGGACAGAATATCTTATT
  197. TACTGTCATGGTATTCCACACAGCATTGCTTCTGACCAGGGAACTCATTT
  198. CACAGCTAATGAGGTGCATCCATGGGCTTGTGCTCATGTAAGTCACTGGC
  199. CTTAAGCATCCACCTAATAGAACAGAGGAACGGCCATTTGAAGACTTCGT
  200. TATGGTGCCAGTTGCGGGGAGCTTTTTGCAGGACTTGGGTAATGTCTTTT
  201. GAGGTGCAATACGTTTACTGAATCTCAGTATATGGTGCAGTTTCCTCTGT
  202. GGTCAAAACTCAGAGGGTGCAGACAGACTTCAAGAGGTAGAAATGGCAGT
  203. GGCTCCCCTCACTGCTATTCCTAATGACCCACATTTTTTTCCTGCCCCTG
  204. CAACTTTGGGATTCTCTGGTTTGGAGGTCTTAGTTCTCATGGAATTTACA
  205. GAAAGAGAAATACAAATGGGTAAGACACATGTGCAAAAATGATCAACTCA
  206. CAAGTAATCAAATAAATGCAAGTTAAAACAATAAATATCACTTTACCTCT
  207. TACATTCGTAATGATAAATGGTAATATCTAATGTTGATATTGGTGAGGAT
  208. AAACAGATTTTCTTGTATGCTCTTTCTAGAGAAAAATATATTCCAAAGGT
  209. CTTAAAATGTGCATCTCTTTGATCAAGTGATTCTACCTTTGGGAATTTAG
  210. TTTAGTGGCTCCAGTCTGGTTTAAAGCCCAGTTTTTGGAACCAGACCAAC
  211. CTGGGTATGAGTTCTGTCTCTGACAAATACAGCTGTGTTCATTGGGTAAG
  212. CTGGATCTCTTCCAGATAAAGTAGAATACACACCAAATATATGGTAGCTA
  213. TTATCATCACCTTTAGCAAAAAATTATCGGTGTTCCCAAAGAATTAGCCA
  214. CATGGATGTTCATCATAGTATTGTTTTTAATAGTAAAAACTTGGAAACCA
  215. GCTGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCTAAG
  216. GCAGGTAGATCACTTGAGGTCAGGTGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATATA
  217. GTGAAACCCTGTCTTTACTAAAAATACAAAAATTAACCAGGCTACTACAA
  218. AAATCAGTCCCTGTAGTCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCATGAGAATC
  219. ACTTGAACCTAAGAGGCGAAGGCTGCAGTGAGCTGAAATCATACCACTGC
  220. TTTCTAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAATAAAAA
  221. AAATTGGAAGCCACCTAAATATTCATTAATTGAAGATCACCTAAAAAATT
  222. ACAATGCATTGGTTGAATAAAATACTATATATCAGCCAGGTGCAGTGGCT
  223. CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCATCTG
  224. AGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCGCATCTCC
  225. ACTAAAAATACGAAACATTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGCACCTGTAATCC
  226. CACCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGG
  227. AGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGTACTCCAGCCTGGGTGACAG
  228. AGCGAGATTCTGTCTCAAGGAAAAAAAAAAAAAAACCTATATATTGATTA
  229. AAAATATTTATAGGAGTATTTAATGAAATGAAATGGAAAGATATTAACAA
  230. TACACTATTAGATGAAAAAGCAAGTTTTAAAATATATACTATATAATGTC
  231. ATTTTAATGTTTTTTAAAAGTTATATGTTATGCATAAAACTAATGCTTGC
  232. ATGATGTAAAATATAGTGGACATAGTTATTATTCTGTTTGAGAGACAGGA
  233. AATTAGATGATTTTCATTTTCTCCTTCGACTACTCCATATTCTCCACATT
  234. TATTTTGGAAATAACTACGTATTGCATTTGTAATGTTAAAAAAAAAAACT
  235. CCCCCCTCAAACCAGTGTGGGTTTAAAGATGTCAACGTTTATTTTAGATT
  236. CAGTGGGTACATGTGCAGGATTGTTACAAGCATATATTGCATGGTGCTGA
  237. GATTTGGGGTATGACCAAACCATCACCCAGCCTTCCCCTTCCTCCCTCCC
  238. CTTTCTCATAGCCCCCAGTGTCTATTGCTCCCATTTTTTTTTTTTTTTGA
  239. GATGGAGTCTCACTGTGT
  240.  
  241. TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCTGC <- LTR
  242. CTCCCGGGTTCCAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTACAGGCACG
  243. CGCAACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA
  244. ACATATTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCGTGATCCACCCGCC
  245. TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCA
  246.  
  247. CTGT <- TSR
  248.  
  249. GCCCAGCCTATTGCTCCCATCTTTATGTCCATGTGTACCT
  250. AATGTTTAGCTCCCACTTACAAGTGAGAACATGCAGTATTGGGTTTTCTG <- Post sequence
  251. TTTCTGCGTTAATTTCCTTAGGATAATGGCCTCCAGCTATACCCATGTTG
  252. TAGCAAAAGACATGATTTCATTCATTCTTTTTTTTTTTTCCCCCGAGACA
  253. GAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAATGGCATGATCTCAGCTC
  254. ACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGAATAGTATTCCACGGTGTATAT
  255. GCACCATATTTTCTTTATCCAATCCACTGTTGATGGACACCTAGGTTGAT
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