Cały proces szyfrowania jest zupełnie niewidzialny. W momencie kopiowania danego pliku na szyfrowany dysk, jego niewielkie kawałki (jeśli jest on zbyt duży np. film) kopiowane są najpierw do pamięci RAM a dopiero później zapisywane są w docelowym miejscu. Odszyfrowanie odbywa się na tej samej zasadzie, najpierw plik częściami kopiowany jest do pamięci RAM, następnie przekazywany jest użytkownikowi. TrueCrypt nigdy nie zapisuje nie zaszyfrowanych danych na dysku, zawsze dane szyfrowane są najpierw w RAM. Jest to bardzo wygodne rozwiązanie i zabezpiecza nas przed przypadkowym przechwyceniem plików.