Перед перемещением файла в классе Upload происходит проверка на количество файлов в директории

$directoryName = $database->getLastFileFromImages();

$directory->checkDirectory($directoryName);

Если (количество файлов > 500)

$directoryName = $directory->createNewDirectoryForImage ();
//createNewDirectory(); - возвращает название созданной папки

Затем перемещаем файл и добавляем запись в базу данных
move_uploaded_file($temp, "uploads/{$directoryName}/" . $name);

$database->addImage($originalname, $name, $hash, $extension, $directory);


Для превью аналогично за исключением строки создания

imagejpeg($image_p, __DIR__ . '/../thumbnails/{$directoryName}/' . $thumbnailName, 100);