short morning
short evening

if ( GameHour >= 9 )
        if ( GameHour < 21 )
                if ( morning == 0 )
                        PositionCell -131545 220782 90 0 "Солстхейм, побережье Фелсаад"; без CELLID, если НПЦ должен быть в экстерьере
                        set morning to 1
                        set evening to 0
                endif
elseif ( GameHour < 9 )
	if ( GameHour <= 21 )
                if ( evening == 0 )
                        PositionCell 3633 2868 12726 10800 "Каюта Катти Сарк"; gradus выставляет НПЦ относительно севера (север берется за 0 ) по часовой стрелке, но не в градусах, а в минутах
                        set evening to 1
                        set morning to 0
               endif
        endif
endif

Если же и это не прокатит, до попробуй так:
short morning
short evening

if ( GameHour >= 9 )
        if ( GameHour < 21 )
                if ( morning == 0 )
                        PositionCell -131545 220782 90 0 "Солстхейм, побережье Фелсаад"; без CELLID, если НПЦ должен быть в экстерьере
                        set morning to 1
                        set evening to 0
                endif
	endif
endif

if ( GameHour < 9 )
	if ( GameHour <= 21 )
                if ( evening == 0 )
                        PositionCell 3633 2868 12726 10800 "Каюта Катти Сарк"; gradus выставляет НПЦ относительно севера (север берется за 0 ) по часовой стрелке, но не в градусах, а в минутах
                        set evening to 1
                        set morning to 0
               endif
        endif
endif
P.S. Стоит поколдовать с return'ами, если и этот вариант не подействует.