Advertisement
GREY_FOX

UMLS Similarity test

Oct 30th, 2014
147
0
Never
Not a member of Pastebin yet? Sign Up, it unlocks many cool features!
Bash 17.39 KB | None | 0 0
  1. nino@nino-pc:~/UMLS-Similarity/$ perl Makefile.PL
  2. Checking if your kit is complete...
  3. Looks good
  4. Writing Makefile for UMLS::Interface
  5. Writing MYMETA.yml and MYMETA.json
  6.  
  7. nino@nino-pc:~/UMLS-Similarity/$ make
  8. cp lib/UMLS/Interface/ErrorHandler.pm blib/lib/UMLS/Interface/ErrorHandler.pm
  9. cp lib/UMLS/Interface/ICFinder.pm blib/lib/UMLS/Interface/ICFinder.pm
  10. cp lib/UMLS/Interface/PathFinder.pm blib/lib/UMLS/Interface/PathFinder.pm
  11. cp lib/UMLS/Interface.pm blib/lib/UMLS/Interface.pm
  12. cp lib/UMLS/Interface/CuiFinder.pm blib/lib/UMLS/Interface/CuiFinder.pm
  13. cp lib/UMLS/Interface/STFinder.pm blib/lib/UMLS/Interface/STFinder.pm
  14. cp utils/getStDef.pl blib/script/getStDef.pl
  15. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getStDef.pl
  16. cp utils/findNumberOfCloserConcepts.pl blib/script/findNumberOfCloserConcepts.pl
  17. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/findNumberOfCloserConcepts.pl
  18. cp utils/findPathToRoot.pl blib/script/findPathToRoot.pl
  19. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/findPathToRoot.pl
  20. cp utils/getIntrinsicIC.pl blib/script/getIntrinsicIC.pl
  21. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getIntrinsicIC.pl
  22. cp utils/getAssociatedCuis.pl blib/script/getAssociatedCuis.pl
  23. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getAssociatedCuis.pl
  24. cp utils/getSemanticRelation.pl blib/script/getSemanticRelation.pl
  25. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getSemanticRelation.pl
  26. cp utils/getCuiList.pl blib/script/getCuiList.pl
  27. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getCuiList.pl
  28. cp utils/getRelated.pl blib/script/getRelated.pl
  29. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getRelated.pl
  30. cp utils/getIC.pl blib/script/getIC.pl
  31. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getIC.pl
  32. cp utils/getStString.pl blib/script/getStString.pl
  33. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getStString.pl
  34. cp utils/getCuiDef.pl blib/script/getCuiDef.pl
  35. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getCuiDef.pl
  36. cp utils/getParents.pl blib/script/getParents.pl
  37. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getParents.pl
  38. cp utils/getAssociatedTerms.pl blib/script/getAssociatedTerms.pl
  39. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getAssociatedTerms.pl
  40. cp utils/findShortestPath.pl blib/script/findShortestPath.pl
  41. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/findShortestPath.pl
  42. cp utils/getSemanticGroup.pl blib/script/getSemanticGroup.pl                                                                                                                                                                                  
  43. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getSemanticGroup.pl                                                                                                                                                        
  44. cp utils/findShortestPathLength.pl blib/script/findShortestPathLength.pl                                                                                                                                                                      
  45. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/findShortestPathLength.pl                                                                                                                                                  
  46. cp utils/getExtendedDef.pl blib/script/getExtendedDef.pl                                                                                                                                                                                      
  47. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getExtendedDef.pl                                                                                                                                                          
  48. cp utils/findNumberTurns.pl blib/script/findNumberTurns.pl                                                                                                                                                                                    
  49. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/findNumberTurns.pl                                                                                                                                                          
  50. cp utils/findCuiDepth.pl blib/script/findCuiDepth.pl                                                                                                                                                                                          
  51. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/findCuiDepth.pl                                                                                                                                                            
  52. cp utils/getChildren.pl blib/script/getChildren.pl                                                                                                                                                                                            
  53. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getChildren.pl                                                                                                                                                              
  54. cp utils/findDFS.pl blib/script/findDFS.pl                                                                                                                                                                                                    
  55. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/findDFS.pl                                                                                                                                                                  
  56. cp utils/getTableNames.pl blib/script/getTableNames.pl                                                                                                                                                                                        
  57. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getTableNames.pl                                                                                                                                                            
  58. cp utils/findLeastCommonSubsumer.pl blib/script/findLeastCommonSubsumer.pl                                                                                                                                                                    
  59. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/findLeastCommonSubsumer.pl                                                                                                                                                  
  60. cp utils/getSts.pl blib/script/getSts.pl                                                                                                                                                                                                      
  61. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getSts.pl                                                                                                                                                                  
  62. cp utils/getCompounds.pl blib/script/getCompounds.pl                                                                                                                                                                                          
  63. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getCompounds.pl                                                                                                                                                            
  64. cp utils/getRelations.pl blib/script/getRelations.pl                                                                                                                                                                                          
  65. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/getRelations.pl                                                                                                                                                            
  66. cp utils/removeConfigData.pl blib/script/removeConfigData.pl                                                                                                                                                                                  
  67. /usr/bin/perl -MExtUtils::MY -e 'MY->fixin(shift)' -- blib/script/removeConfigData.pl                                                                                                                                                        
  68. Manifying blib/man1/getCompounds.pl.1p                                                                                                                                                                                                        
  69. Manifying blib/man1/removeConfigData.pl.1p                                                                                                                                                                                                    
  70. Manifying blib/man1/getRelations.pl.1p                                                                                                                                                                                                        
  71. Manifying blib/man1/getExtendedDef.pl.1p                                                                                                                                                                                                      
  72. Manifying blib/man1/findShortestPathLength.pl.1p                                                                                                                                                                                              
  73. Manifying blib/man1/getSemanticGroup.pl.1p                                                                                                                                                                                                    
  74. Manifying blib/man1/findShortestPath.pl.1p
  75. Manifying blib/man1/getAssociatedTerms.pl.1p
  76. Manifying blib/man1/getParents.pl.1p
  77. Manifying blib/man1/getTableNames.pl.1p
  78. Manifying blib/man1/findDFS.pl.1p
  79. Manifying blib/man1/getSts.pl.1p
  80. Manifying blib/man1/findLeastCommonSubsumer.pl.1p
  81. Manifying blib/man1/getChildren.pl.1p
  82. Manifying blib/man1/findCuiDepth.pl.1p
  83. Manifying blib/man1/findNumberTurns.pl.1p
  84. Manifying blib/man1/getCuiList.pl.1p
  85. Manifying blib/man1/getSemanticRelation.pl.1p
  86. Manifying blib/man1/getAssociatedCuis.pl.1p
  87. Manifying blib/man1/getStString.pl.1p
  88. Manifying blib/man1/getCuiDef.pl.1p
  89. Manifying blib/man1/getIC.pl.1p
  90. Manifying blib/man1/getRelated.pl.1p
  91. Manifying blib/man1/findNumberOfCloserConcepts.pl.1p
  92. Manifying blib/man1/getStDef.pl.1p
  93. Manifying blib/man1/getIntrinsicIC.pl.1p
  94. Manifying blib/man1/findPathToRoot.pl.1p
  95. Manifying blib/man3/UMLS::Interface::ICFinder.3pm
  96. Manifying blib/man3/UMLS::Interface::STFinder.3pm
  97. Manifying blib/man3/UMLS::Interface.3pm
  98. Manifying blib/man3/UMLS::Interface::ErrorHandler.3pm
  99. Manifying blib/man3/UMLS::Interface::PathFinder.3pm
  100. Manifying blib/man3/UMLS::Interface::CuiFinder.3pm
  101.  
  102. nino@nino-pc:~/UMLS-Similarity/$ make test
  103. PERL_DL_NONLAZY=1 /usr/bin/perl "-MExtUtils::Command::MM" "-e" "test_harness(0, 'blib/lib', 'blib/arch')" t/*.t
  104. t/access.t ................... ok  
  105. t/findCuiDepth.t ............. ok  
  106. t/findDFS.t .................. ok                                                                                                                                                                                                            
  107. t/findLeastCommonSubsumer.t .. ok                                                                                                                                                                                                            
  108. t/findPathToRoot.t ........... ok                                                                                                                                                                                                            
  109. t/findShortestPath.t ......... ok                                                                                                                                                                                                            
  110. t/functions.t ................ ok                                                                                                                                                                                                            
  111. t/getAssociatedCuis.t ........ ok                                                                                                                                                                                                            
  112. t/getAssociatedTerms.t ....... ok                                                                                                                                                                                                            
  113. t/getChildren.t .............. ok                                                                                                                                                                                                            
  114. t/getCompounds.t ............. ok                                                                                                                                                                                                            
  115. t/getCuiDef.t ................ ok                                                                                                                                                                                                            
  116. t/getCuiList.t ............... ok                                                                                                                                                                                                            
  117. t/getExtendedDef.t ........... ok                                                                                                                                                                                                            
  118. t/getIC.t .................... ok                                                                                                                                                                                                            
  119. t/getParents.t ............... ok                                                                                                                                                                                                            
  120. t/getRelated.t ............... ok                                                                                                                                                                                                            
  121. t/getRelations.t ............. ok                                                                                                                                                                                                            
  122. t/getSemanticGroups.t ........ ok                                                                                                                                                                                                            
  123. t/getSemanticRelation.t ...... ok                                                                                                                                                                                                            
  124. t/getStDef.t ................. ok                                                                                                                                                                                                            
  125. t/getSts.t ................... ok                                                                                                                                                                                                            
  126. t/mysql.t .................... ok                                                                                                                                                                                                            
  127. t/options.t .................. ok                                                                                                                                                                                                            
  128. t/prgs.t ..................... ok                                                                                                                                                                                                            
  129. All tests successful.                                                                                                                                                                                                                        
  130. Files=25, Tests=268, 7135 wallclock secs ( 0.14 usr  0.05 sys + 46.37 cusr  7.28 csys = 53.84 CPU)                                                                                                                                            
  131. Result: PASS
Advertisement
Add Comment
Please, Sign In to add comment
Advertisement