fdf.groupby(['row','col'])['percent'].sum()

row  col
1    10     0.0000
     11     1.9500
     2      0.0000
     3      2.2500
     4      0.0000
     5      1.4600
     6      0.0000
     7      1.3100
     8      0.0000
     9      1.6400
2    1      0.0008
     10     1.8863
     11     0.0013
     12     1.9538
     2      2.0900
     3      0.0008
     4      1.5458
     5      0.0006
     6      1.2093
     7      0.0000
     8      1.1021
     9      0.0000
3    1      1.7200
     10     0.0000
     11     2.4200
     12     0.0000
     2      0.0000
     3      1.1900
     4      0.0000
     5      1.4800
     6      0.0000
     7      3.6000
     8      0.0000
     9      2.1000
4    1      0.0000
     10     1.4000
     11     0.0000
     12     1.7200
     2      1.2600
     3      0.0000
     4      2.6300
     5      0.0000
     6      2.6600
     7      0.0000
     8      2.1900
     9      0.0000
5    1      2.2880
     10     0.0005
     11     1.8423
     12     0.0006
     2      0.0003
     3      1.7836
     4      0.0006
     5      2.1180
     6      0.0008
     7      1.5533
     8      0.0013
     9      1.6205
6    1      0.0000
     10     1.8300
     11     0.0000
     12     2.4800
     2      1.7000
     3      0.0000
     4      2.3500
     5      0.0000
     6      3.7300
     7      0.0000
     8      1.8100
     9      0.0000
7    1      1.6700
     10     0.0000
     11     1.7900
     12     0.0000
     2      0.0000
     3      2.4200
     4      0.0000
     5      2.3000
     6      0.0000
     7      2.2900
     8      0.0000
     9      2.7100
8    10     2.3200
     11     0.0000
     2      2.7600
     3      0.0000
     4      1.8000
     5      0.0000
     6      2.2000
     7      0.0000
     8      2.8600
     9      0.0000