// obtenemos la plantilla JRXML como un stream
InputStream template = JasperReportsApplication.class
    .getResourceAsStream("/sampleReport.xml");
// compilamos el reporte desde el stream
JasperReport report = JasperCompileManager.compileReport(template);
// llenamos el reporte en un print object, listo para exportar
JasperPrint print = JasperFillManager.fillReport(report, new HashMap<String, String>());
// Lo exportamos!
File pdf = File.createTempFile("output.", ".pdf");
JasperExportManager.exportReportToPdfStream(print, new FileOutputStream(pdf));