$(document).ready(function() {
    $('li:first').animate({ 'background-color': "#FF9900", "opacity": "0.5" }, 1900).queue(function() {
        $(this).css({ 'background': '', "opacity": "" })
    })
})

$(document).ready(function() {
    setTimeout(function() {
        $('li:first').animate({ 'background-color': "#FF9900", "opacity": "0.5" }, 1900).queue(function () {
            $(this).css({ 'background': '', "opacity": "" })
        })
    }, 100);
})

window.onload = function () {
    //тут анимация ваша
}

$( window ).load(function() {
  // Run code
});