IPI

<?php
print "\nDomaci ukol do IPI, Jakub Machalicky, xmacha28\n\n";



$infile = "";
$outfile = "";
$infile = $argv[1];
$vysledek="";
$out;

if($infile == "")
{
    print "nebyl zadan vstupni soubor\n";
    print "Soubor se zadava jako parametr napr tedy ipi.exe soubor.txt\n";
    print "ale to mi vubec nevadi a vytvarim si sam test.txt\n\n";
    $test = "CCTGTATTAGCAGCAGATTCGATTAGCTTTACAACAATTCAATAAAATAGCTTCGCGCTAA\nATTTTTAACTTTTCTCTGTCGTCGCACAATCGACTTTCTCTGTTTTCTTGGGTTTACCGGAA\nTTGTTTCTGCTGCGATGAGGTATTGCTCGTCAGCCTGAGGCTGAAAATAAAATCCGTGGT\nCACACCCAATAAGTTAGAGAGAGTACTTTGACTTGGAGCTGGAGGAATTTGACATAGTCGAT\nTCTTCTCCAAGACGCATCCACGTGAACCGTTGTAACTATGTTCTGTGC\nCCACACCAAAAAAACTTTCCACGTGAACCGAAAACGAAAGTCTTTGGTTTTAATCAATAA\nGTGCTCTCTTCTCGGAGAGAGAAGGTGGGCTGCTTGTCTGCCGATGTACTTTATTAAATCCAATAA\nCCACACCAAAAAAACTTTCCACGTGTGAACTATACTCCAAAAACGAAGTATTGGTTTATCATAA\nTCTGAAAAGTGCAAAGAACGATGATGATGATGATAGAGGAACCTGAGCAGCCATGTCTGAACCTATAGC\nGTATTGGTCGTCGTGCGACTAAATTAGGTAAAAAAGTAGTTCTAAGAGATTTTGATGATTCAATGCAAAGTTCTATTAATCGTTCAATTG\n";
    $newfile2 = fopen('test.txt', "w") or die("Nejde vytvorit test soubor a nevim proc");
    fwrite($newfile2, $test);
    fclose($newfile2);
    $infile = "test.txt";
}


$vstup = file_get_contents($infile, true);
$vstup = explode("\n", $vstup);
$GLOBALS['vysledek'] = "";

function zvyraznit_vysledek($vstup){
$prvni = "";
$druhy = "";
$treti = "";

    for($i=0; $i<count($vstup); $i++){
        if($vstup[$i]!=""){
            if(strpos($vstup[$i], $GLOBALS['vysledek']) === false)
            {
                echo "   ".strtolower($vstup[$i])."\n";
                $GLOBALS['out'] .= strtolower($vstup[$i])."\n";
            }
            else{
                $n = strpos($vstup[$i], $GLOBALS['vysledek']);

                $prvni = substr($vstup[$i] ,0,$n);
                $druhy = substr($vstup[$i], $n, strlen($GLOBALS['vysledek']));
                $treti = substr($vstup[$i], strlen($prvni) + strlen($GLOBALS['vysledek']),strlen($vstup[$i]) + strlen($prvni) + strlen($druhy));

                echo "   ".strtolower($prvni)." => ".strtoupper($druhy)." <= ".strtolower($treti)."\n";
                $GLOBALS['out'] .= strtolower($prvni)." => ".strtoupper($druhy)." <= ".strtolower($treti)."\n";
            }
        }
    }
    echo "\n\nNejdelsi sekvence: ".$GLOBALS['vysledek']."\n";
}
function hledej2($co, $kdee){
    $maxi = "";
    $pocStr = $co;
    $pracStr = $pocStr;
    $kde = $kdee;
    if($pocStr!=$kde){
        while (strlen($pocStr)!=1)
        {
            if(strpos($kde, $pracStr) === false)
            {
                $pracStr = substr($pracStr, 0, strlen($pracStr)-1);
            }
            else
            {

                if(strlen($pracStr) > strlen($maxi))
                {

                    $maxi=$pracStr;
                }
                $pracStr = substr($pracStr, 0, strlen($pracStr)-1);
            }

            if(strlen($pracStr)==1)
            {
                $pocStr = substr($pocStr, 1, strlen($pocStr)-1);
                $pracStr = $pocStr;
            }
        }
    }
    return $maxi;
}

function hledej($vstup = array()){
    $pom = "";
    for($i=0; $i<count($vstup); $i++){
        if($vstup[$i]!=""){
            for($j=0; $j<count($vstup); $j++){
                if($vstup[$j]!=""){
                    $pom = hledej2($vstup[$i],$vstup[$j]);
                    if(strlen($pom) > strlen($GLOBALS['vysledek'])){
                        $GLOBALS['vysledek']=$pom;
                    }
                }
            }
        }
    }
}




$newfile = fopen($infile.'_output.txt', "w") or die("Nejde vytvorit vystupni soubor a nevim proc");
$outfile = $infile.'_output.txt';
hledej($vstup);
zvyraznit_vysledek($vstup);
fwrite($newfile, "\n\nNejdelsi sekvence: ".$vysledek."\n");
fwrite($newfile, "\nDomaci ukol do IPI, Jakub Machalicky, xmacha28\n\n\n");
fwrite($newfile, $out);
fclose($newfile);

print "Jo a taky je vysledek ulozen do souboru $outfile!\n";
system("pause");
?>