INSERT INTO `table` (`id`, `name`, `email`)
VALUES
('1-', 'oleg', 'qqq@mail.ru'),
('2-', 'dima', 'ggg@mail.ru'),
('3-', 'petr', 'mmm@mail.ru'),
('4-', 'anna', 'nnn@mail.ru')
и так далее...
ON DUPLICATE KEY UPDATE `name` = ????? `email` = ??????

<?
// $arr - массив данных (порядка 10к строк формата: "('1-', 'oleg', 'qqq@mail.ru')")
$mysqli->query("
    INSERT INTO `table` (`id`, `name`, `email`)
    VALUES ".implode(",", $arr)."
    ON DUPLICATE KEY UPDATE `name` = ????? `email` = ??????
")
?>