Guardar / Cargar arenas.

// CREAR ARENA (GUARDARLA A UN ARCHIVO YAML Y VOLVERLO A LLAMAR DESPUÉS)
private void createArena(String arenaName, Player player) {
    WorldEditPlugin worldEdit = (WorldEditPlugin) Bukkit.getServer().getPluginManager().getPlugin("WorldEdit"); // INICIALIZAMOS WORLD EDIT
    if (worldEdit == null) { // SI NO SE ENCUENTRA
        Log.Error("WorldEdit Not Load"); // PRINT
    }else{ // SI SE ENCONTRÓ WORLD EDIT
        Selection sel = worldEdit.getSelection(player); // RECOGEMOS
        int X1 = sel.getMaximumPoint().getBlockX(); // LAS SELECCIONES
        int Y1 = sel.getMaximumPoint().getBlockY(); // DESDE X1,Y1,Z1
        int Z1 = sel.getMaximumPoint().getBlockZ(); // HASTA X2, Y2, Z2
        int X2 = sel.getMinimumPoint().getBlockX();
        int Y2 = sel.getMinimumPoint().getBlockY();
        int Z2 = sel.getMinimumPoint().getBlockZ();
        Location loc1 = new Location(sel.getWorld(),X1, Y1, Z1); // ASÍ ENCONTRAREMOS EL CUADRADO QUE HACEMOS CON WORLD EDIT
        Location loc2 = new Location(sel.getWorld(),X2, Y2, Z2);
        World world = sel.getWorld();
        String name = arenaName;
        Config saveFile = new Config(name, "NOMBREDETUPLUGIN", "Arenas"); // GUARDAMOS LA ARENA A UN ARCHIVO (VEÁSE ABAJO LA CLASE INHERENTE)
        saveFile.delete();
        saveFile.create();
        for (int x = X2; x < X1; x++) { // formula para conseguir todos los bloques en ese cuadrado
            for (int y = Y2; y < Y1; y++) {
                for (int z = Z2; z < Z1; z++) {
                    Block block = world.getBlockAt(x, y, z); // recogemos cada bloque

                    saveFile.getConfig().set("BLOCKS." + x + "," + y + "," + z, // lo guardamos al
                            block.getType().toString() + ":" + block.getData()); // archivo de configuracion previamente creado
                }
            }
        }
        saveFile.getConfig().set("BLOCKS.WORLD", world.getName());
        saveFile.getConfig().options().copyDefaults(true);
        saveFile.save();
    }
}

// CARGAR UNA ARENA POR SEPARADO.
private void loadArena(String arenaName) {
    Config saveFile = new Config(arenaName, "NOMBREDETUPLUGIN", "Arenas"); // Conseguimos el archivo de configuración
    ConfigurationSection privateSection = saveFile.getConfig().getConfigurationSection("BLOCKS"); // conseguimos las keys que habiamos creado antes
    for (String location : privateSection.getKeys(false)) { // empezamos a agarrar todos los bloques (y su data) de la configuración
        if (!location.equalsIgnoreCase("WORLD")){ // y los empezamos a colocar en donde estaban.
            String[] cords = location.split(",");
            int X = Integer.valueOf(cords[0]);
            int Y = Integer.valueOf(cords[1]);
            int Z = Integer.valueOf(cords[2]);
            String[] Blockdata = saveFile.getConfig().getString("BLOCKS." + location).split(":");
            String material = Blockdata[0];
            World getter = Bukkit.getWorld(saveFile.getConfig().getString("BLOCKS.WORLD"));
            byte data = Byte.valueOf(Blockdata[1]);
            getter.getBlockAt(X, Y, Z).setType(Material.matchMaterial(material)); // aquí donde colocamos el material
            getter.getBlockAt(X, Y, Z).setData(data); // aquí es donde colocamos la data del material
        }
    }
}

//Pequeña clase de configuración que hice, ustedes utilicen la suya o dejenla así, igual funciona.
class Config(){
    File fileDir;
    File pFile;
    FileConfiguration config;

    public Config(String fileName, String pluginName) {
        this.FileDir = new File(Bukkit.getPluginManager().getPlugin(pluginName).getDataFolder(), "");
        this.pFile = new File(Bukkit.getPluginManager().getPlugin(pluginName).getDataFolder(), fileName + ".yml");
        this.config = YamlConfiguration.loadConfiguration(this.pFile);
    }

    public Config(String fileName, String pluginName, String folder) {
        try{
            this.fileDir = new File(Bukkit.getPluginManager().getPlugin(pluginName).getDatafolder() + "\\" + folder, "");
            this.pFile = new File(Bukkit.getPluginManager().getPlugin(pluginName).getDatafolder() + "\\" + folder, fileName + ".yml");
            this.config = YamlConfiguration.loadConfiguration(this.pFile);
        }catch(YAMLException event){
            event.printStackTrace();
        }
    }

    public FileConfiguration getConfig() {
        return this.config;
    }

    public void save() {
        this.config.options().copyDefaults(true);
        try {
            this.config.save(this.pFile);
        } catch (IOException var2) {
            Log.Error(var2.getMessage());
        }
    }

    public void create() {
        if(!this.fileDir.exists()) {
            this.fileDir.mkdir();
        }
        if(!this.pFile.exists()) {
            try {
                this.pFile.createNewFile();
            } catch (Exception var2) {
                Log.Error(var2.getMessage());
            }
        }
    }

    public void delete() {
        this.pFile.delete();
    }

}