Quitar comentarios

import java.io.*;

public class quita_comentarios {

    /**
     * Escribe un programa capaz de quitar los comentarios de un programa de
     * Java. Se utilizaría de la siguiente manera:
     * quita_commentarios PROGRAMA_ORIGINAL PROGRAMA_LIMPIO
     * Por ejemplo:
     * quita_comentarios hola.java holav2.java
     * crea un fchero con nombre holav2.java que contiene el código de hola.java
     * pero sin los comentarios.
     */
    public static void main(String[] args) {
        try{
            BufferedReader br = new BufferedReader(new FileReader(args[0]));
            if (!args[0].contains(".java")){
                    System.out.println("Lo siento, este programa solo funciona con ficheros cuya extension es \".java\".");
            }   else{
                    BufferedWriter bw = new BufferedWriter(new FileWriter(args[0].replace(".java", "v2.java")));

                    String linea = "evitaPrimerSalto";
                    while (linea != null){
                        if (!linea.equals("evitaPrimerSalto")){
                            if (!linea.contains("/*") && !linea.contains("//"))
                                    bw.write(linea+"\n");
                        }
                        char[] lineaAr = new char[linea.length()];
                        for (int i = 0; i < linea.length(); i++)
                            lineaAr[i] = ' ';
                        if (linea.contains("//")){
                            linea.getChars(0, linea.indexOf("//"), lineaAr, 0);
                            bw.write(lineaAr);
                            bw.write("\n");
                        }
                        char[] lineaAr2 = new char[linea.length()];
                        for (int i = 0; i < linea.length(); i++)
                            lineaAr2[i] = ' ';
                        if (linea.contains("/*")){
                            linea.getChars(0, linea.indexOf("/*"), lineaAr2, 0);
                            bw.write(lineaAr2);
                            bw.write("\n");
                            while (!linea.contains("*/"))
                                linea = br.readLine();
                        }
                        char[] lineaAr3 = new char[linea.length()];
                        for (int i = 0; i < linea.length(); i++)
                            lineaAr3[i] = ' ';
                        if (linea.contains("*/")){
                            linea.getChars(linea.indexOf("*/")+2, linea.length(), lineaAr3, 0);
                            bw.write(lineaAr3);
                            bw.write("\n");
                        }
                        linea = br.readLine();
                    }//while != null
                    bw.close();
                }//else
            br.close();
            System.out.println("\n¡Comentarios eliminados! ;)\n");
        }catch (IOException ioe){
            System.out.println("Se ha producido un error de lectura/escritura");
            System.err.println(ioe.getMessage());
        }
    }
}