vetoStuff

public static doStuff(VetoSet[] input) {
    Pair[][] p = vetoSetToPairArray(input);
    for(Pair[] m : p) {
        for(Pair n : m)
            System.out.println(n.toString());
        System.out.println("SEPARATOR");
    }
}

private static Pair[][] vetoSetToPairArray(VetoSet[] input) throws Exception {
    if(!validVetoSetArray(input)) { throw new Exception("Bad VSA"); }
    Pair[][] pairArray = new Pair[input[0].getVetoPairs().length][input.length];
    for(int i = 0; i < input.length; i++)
        pairArray[i] = input[i].getVetoPairs();
    return pairArray;
}

// This function returns false if the VetoSet array (pairs) isn't rectangular
private static boolean validVetoSetArray(VetoSet[] input) {
    int l = input[0].getVetoPairs().length;
    for(VetoSet v : input)
        if(v.getVetoPairs().length != l) { return false; }
    return true;
}