var domain = new List<string>();
        // MYSQL
        string serverName = "";
        string userName = "s";
        string dbName = "";
        string port = "";
        string password = "";
        string connStr = "server=" + serverName + ";user=" + userName + ";database=" + dbName + ";port=" + port + ";password=" + password + ";SslMode=none;";
        MySqlConnection conn = new MySqlConnection(connStr);
        string sql = "SELECT * FROM domain";
        MySqlCommand myCommand = new MySqlCommand(sql, conn);
        conn.Open();
        MySqlDataReader reader = myCommand.ExecuteReader();
        while (reader.Read())
            domain.Add(reader.GetString(0));
        conn.Close();
        //MySQL Ends

        string[] allLines = File.ReadAllLines(pathFile, Encoding.GetEncoding(1251));//Массив строк который получает строки из файла, который нужно изменить
        for (int i = 0; i < countline; i++ )//Цикл , который при каждом повторении проверяет что бы файл не содержал строки по индексу литерала цикла.
       {
            var re = File.ReadAllLines(pathFile, Encoding.Default).Where(s => !s.Contains(domain[i]));//изменение файла
         File.WriteAllLines("file.txt", re, Encoding.Default);//Перезапись файла
        }

var pathFile = @"D:ВЛАДtest.txt";//Тут Ваш путь файла который нужно отсеять
var newpath = @"pathnewfile.txt";//Тут путь куда нужно отсеянный файл сохранить
string[] re;
var domain = new List<string>  //Список с строками которых быть не должно
{
    "get",    //Добавил для примера
    "try"
};
string[] allLines = File.ReadAllLines(pathFile);//Файл изначально
    foreach (var item in domain)
    {
    re = File.ReadAllLines(pathFile, Encoding.Default).Where(s => !s.Contains(item));

    }
    File.WriteAllLines(newpath, re, Encoding.Default);
}

var pathFile = @"D:ВЛАДtest.txt";//Тут Ваш путь файла который нужно отсеять
var newpath = @"pathnewfile.txt";//Тут путь куда нужно отсеянный файл сохранить
var domain = new List<string>  //Список с строками которых быть не должно
{
    "try"
};
string[] allLines = File.ReadAllLines(pathFile); //Файл изначально
var output = new List<string>();

foreach (var line in allLines)
{
    if (!domain.Contains(line))
    {
        output.Add(line);
    }
}
File.WriteAllLines(newpath, output, Encoding.Default);

var pathFile = @"D:ВЛАДtest.txt";//Тут Ваш путь файла который нужно отсеять
var newpath = @"pathnewfile.txt";//Тут путь куда нужно отсеянный файл сохранить
var domain = new List<string>  //Список с строками которых быть не должно
{
    "try"
};
string[] allLines = File.ReadAllLines(pathFile); //Файл изначально
var list = allLines.OfType<string>().Where(x => !domain.Contains(x)).ToList();

File.WriteAllLines(newpath, list, Encoding.Default);