チェックボックスのコード

   public void onCheckboxClicked(View view) {
    // Is the view now checked?
    boolean checked = ((CheckBox) view).isChecked();
    // Check which checkbox was clicked
    switch (view.getId()) {
        case R.id.checkButton:
            if (checked) {
                mRealm.beginTransaction();
                mWordData.setChecked(true);
                mRealm.copyToRealmOrUpdate(mWordData);
                mRealm.commitTransaction();
                mRealm.close(); //ここではちゃんと更新ができている
            } else {
                mRealm.beginTransaction();
                mWordData.setChecked(false);
                mRealm.copyToRealmOrUpdate(mWordData);
                mRealm.commitTransaction();
                mRealm.close();
            }
            break;
    }
}
モデルクラスの一部
public void setChecked(boolean checked) {
    this.checked = checked;
}

public boolean isChecked() {
    return checked;
}
変更が反映されていないactivityのonCreateの一部
    isChecked = mWordData.isChecked();

    if (isChecked) {
        mCheckButton.setChecked(true); //更新してもここではtrueになっていない
    } else {
        mCheckButton.setChecked(false);
    }