function wpdocs_template_scripts() {
    wp_enqueue_style( 'style', get_stylesheet_uri() );
    wp_enqueue_script('modernizer', get_template_directory_uri() .'/js/vendor/modernizr-2.8.3.min.js', null, null, false);
    wp_enqueue_script('bootstrap', get_template_directory_uri() .'/js/bootstrap.min.js', array('jquery'), null, true);
    wp_enqueue_script('main', get_template_directory_uri() .'/js/main.js', array('jquery'), null, true);
}
add_action( 'wp_enqueue_scripts', 'wpdocs_template_scripts' );

(function($) {
 // Your code inside here;
});

$ = jQuery; // This at the top of the file