Набрали объект pass (не важно для задачи), далее:
    using (var myStream = new MemoryStream())
        {
        string fileNamePK = String.Format(часть алгоритма генерации имени+ @"{0}.pkpass", часть алгоритма генерации имени; //не спрашивайте
//Проблема вот здесь:
        byte[] appleCert = File.ReadAllBytes(currDir + "//" + appleCert);
        byte[] appleCertKey = File.ReadAllBytes(currDir + "//" + appleKey);

        PassWriter.WriteToStream(pass, myStream,
                new X509Certificate2(appleCert),
                new X509Certificate2(appleCertKey,appleCertPass,  X509KeyStorageFlags.Exportable));
        FileStream file = new FileStream(FileNamePath + "\" + fileNamePK, FileMode.CreateNew, FileAccess.Write);
        myStream.WriteTo(file);
        file.Close();
        myStream.Close();
        ResultListPass += fileNamePK + ";";
        }

FileStream fs = new FileStream(filePath, FileMode.Open, FileAccess.Read, FileShare.Read);
StreamReader fsr = new StreamReader(fs);
byteArrey = fsr.CurrentEncoding.GetBytes(fsr.ReadToEnd());