seq1 = ["G", "C", "G", "G", "C", "A", "A", "G", "C", "C", "T"]
seq2 = ["G", "C", "G", "G", "C", "A", "G", "G", "C", "C", "T"]
#                                    ^

s1 = seq1.split(//)
s2 = seq2.split(//)
diffs = 0
s1.each_with_index do |x,i|
  if x != s2[i]
    diffs += 1
  end
end