SHARE
TWEET

namd2_idlepoll_p4_devices_0

mahmoodn Mar 12th, 2018 84 Never
Not a member of Pastebin yet? Sign Up, it unlocks many cool features!
  1. Charm++: standalone mode (not using charmrun)
  2. Charm++> Running in Multicore mode:  4 threads
  3. Charm++> Using recursive bisection (scheme 3) for topology aware partitions
  4. Converse/Charm++ Commit ID: v6.7.1-0-gbdf6a1b-namd-charm-6.7.1-build-2016-Nov-07-136676
  5. Warning> Randomization of stack pointer is turned on in kernel, thread migration may not work! Run 'echo 0 > /proc/sys/kernel/randomize_va_space' as root to disable it, or try run with '+isomalloc_sync'.  
  6. CharmLB> Load balancer assumes all CPUs are same.
  7. Charm++> Running on 1 unique compute nodes (16-way SMP).
  8. Charm++> cpu topology info is gathered in 0.000 seconds.
  9. Info: Built with CUDA version 9000
  10. Pe 1 physical rank 1 will use CUDA device of pe 2
  11. Pe 3 physical rank 3 will use CUDA device of pe 2
  12. Pe 0 physical rank 0 will use CUDA device of pe 2
  13. Info: NAMD 2.12 for Linux-x86_64-multicore-CUDA
  14. Info:
  15. Info: Please visit http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/
  16. Info: for updates, documentation, and support information.
  17. Info:
  18. Info: Please cite Phillips et al., J. Comp. Chem. 26:1781-1802 (2005)
  19. Info: in all publications reporting results obtained with NAMD.
  20. Info:
  21. Info: Based on Charm++/Converse 60701 for multicore-linux64
  22. Info: Built Wed Mar 7 23:23:16 +0330 2018 by mahmood on orca
  23. Pe 2 physical rank 2 binding to CUDA device 0 on orca: 'Quadro M2000'  Mem: 4035MB  Rev: 5.2  PCI: 0:23:0
  24. Info: 1 NAMD  2.12  Linux-x86_64-multicore-CUDA  4    orca  mahmood
  25. Info: Running on 4 processors, 1 nodes, 1 physical nodes.
  26. Info: CPU topology information available.
  27. Info: Charm++/Converse parallel runtime startup completed at 0.0287871 s
  28. CkLoopLib is used in SMP with a simple dynamic scheduling (converse-level notification) but not using node-level queue
  29. Info: 18.8203 MB of memory in use based on /proc/self/stat
  30. Info: Configuration file is ubq_ws_eq.conf
  31. Info: Working in the current directory /home/mahmood/namd-2.12/bench/1-1-build
  32. TCL: Suspending until startup complete.
  33. Info: SIMULATION PARAMETERS:
  34. Info: TIMESTEP               2
  35. Info: NUMBER OF STEPS        0
  36. Info: STEPS PER CYCLE        10
  37. Info: LOAD BALANCER  Centralized
  38. Info: LOAD BALANCING STRATEGY  New Load Balancers -- DEFAULT
  39. Info: LDB PERIOD             2000 steps
  40. Info: FIRST LDB TIMESTEP     50
  41. Info: LAST LDB TIMESTEP     -1
  42. Info: LDB BACKGROUND SCALING 1
  43. Info: HOM BACKGROUND SCALING 1
  44. Info: MIN ATOMS PER PATCH    40
  45. Info: INITIAL TEMPERATURE    310
  46. Info: CENTER OF MASS MOVING INITIALLY? NO
  47. Info: DIELECTRIC             1
  48. Info: EXCLUDE                SCALED ONE-FOUR
  49. Info: 1-4 ELECTROSTATICS SCALED BY 1
  50. Info: MODIFIED 1-4 VDW PARAMETERS WILL BE USED
  51. Info: DCD FILENAME           ubq_ws_eq.dcd
  52. Info: DCD FREQUENCY          250
  53. Info: DCD FIRST STEP         250
  54. Info: NO EXTENDED SYSTEM TRAJECTORY OUTPUT
  55. Info: NO VELOCITY DCD OUTPUT
  56. Info: NO FORCE DCD OUTPUT
  57. Info: OUTPUT FILENAME        ubq_ws_eq
  58. Info: BINARY OUTPUT FILES WILL BE USED
  59. Info: RESTART FILENAME       ubq_ws_eq.restart
  60. Info: RESTART FREQUENCY      500
  61. Info: BINARY RESTART FILES WILL BE USED
  62. Info: SWITCHING ACTIVE
  63. Info: SWITCHING ON           10
  64. Info: SWITCHING OFF          12
  65. Info: PAIRLIST DISTANCE      14
  66. Info: PAIRLIST SHRINK RATE   0.01
  67. Info: PAIRLIST GROW RATE     0.01
  68. Info: PAIRLIST TRIGGER       0.3
  69. Info: PAIRLISTS PER CYCLE    2
  70. Info: PAIRLISTS ENABLED
  71. Info: MARGIN                 0
  72. Info: HYDROGEN GROUP CUTOFF  2.5
  73. Info: PATCH DIMENSION        16.5
  74. Info: ENERGY OUTPUT STEPS    100
  75. Info: CROSSTERM ENERGY INCLUDED IN DIHEDRAL
  76. Info: TIMING OUTPUT STEPS    1000
  77. Info: SPHERICAL BOUNDARY CONDITIONS ACTIVE
  78. Info: RADIUS #1              26
  79. Info: FORCE CONSTANT #1      10
  80. Info: EXPONENT #1            2
  81. Info: SPHERE BOUNDARY CENTER(30.3082, 28.805, 15.354)
  82. Info: LANGEVIN DYNAMICS ACTIVE
  83. Info: LANGEVIN TEMPERATURE   310
  84. Info: LANGEVIN USING BBK INTEGRATOR
  85. Info: LANGEVIN DAMPING COEFFICIENT IS 1 INVERSE PS
  86. Info: LANGEVIN DYNAMICS NOT APPLIED TO HYDROGENS
  87. Info: MULTILEVEL SUMMATION METHOD (MSM) FOR ELECTROSTATICS ACTIVE
  88. Info: MSM WITH C1 CUBIC INTERPOLATION AND C2 TAYLOR SPLITTING
  89. Info: FULL ELECTROSTATIC EVALUATION FREQUENCY      2
  90. Info: USING VERLET I (r-RESPA) MTS SCHEME.
  91. Info: C1 SPLITTING OF LONG RANGE ELECTROSTATICS
  92. Info: PLACING ATOMS IN PATCHES BY HYDROGEN GROUPS
  93. Info: RIGID BONDS TO HYDROGEN : ALL
  94. Info:         ERROR TOLERANCE : 1e-08
  95. Info:          MAX ITERATIONS : 100
  96. Info: RIGID WATER USING SETTLE ALGORITHM
  97. Info: RANDOM NUMBER SEED     1520882144
  98. Info: USE HYDROGEN BONDS?    NO
  99. Info: COORDINATE PDB         ./ubq_ws.pdb
  100. Info: STRUCTURE FILE         ./ubq_ws.psf
  101. Info: PARAMETER file: CHARMM format!
  102. Info: PARAMETERS             ./par_all27_prot_lipid.inp
  103. Info: USING ARITHMETIC MEAN TO COMBINE L-J SIGMA PARAMETERS
  104. Info: SUMMARY OF PARAMETERS:
  105. Info: 180 BONDS
  106. Info: 447 ANGLES
  107. Info: 566 DIHEDRAL
  108. Info: 46 IMPROPER
  109. Info: 6 CROSSTERM
  110. Info: 119 VDW
  111. Info: 0 VDW_PAIRS
  112. Info: 0 NBTHOLE_PAIRS
  113. Info: TIME FOR READING PSF FILE: 0.0345869
  114. Info: Reading pdb file ./ubq_ws.pdb
  115. Info: TIME FOR READING PDB FILE: 0.00802517
  116. Info:
  117. Info: ****************************
  118. Info: STRUCTURE SUMMARY:
  119. Info: 6682 ATOMS
  120. Info: 4871 BONDS
  121. Info: 4074 ANGLES
  122. Info: 3293 DIHEDRALS
  123. Info: 204 IMPROPERS
  124. Info: 74 CROSSTERMS
  125. Info: 0 EXCLUSIONS
  126. Info: 6080 RIGID BONDS
  127. Info: 13966 DEGREES OF FREEDOM
  128. Info: 2419 HYDROGEN GROUPS
  129. Info: 4 ATOMS IN LARGEST HYDROGEN GROUP
  130. Info: 2419 MIGRATION GROUPS
  131. Info: 4 ATOMS IN LARGEST MIGRATION GROUP
  132. Info: TOTAL MASS = 41298.8 amu
  133. Info: TOTAL CHARGE = 1.00955e-06 e
  134. Info: *****************************
  135. Info:
  136. Info: Entering startup at 0.086015 s, 27.6797 MB of memory in use
  137. Info: Startup phase 0 took 4.1008e-05 s, 27.6797 MB of memory in use
  138. Info: ADDED 12209 IMPLICIT EXCLUSIONS
  139. Info: Startup phase 1 took 0.00187206 s, 28.9688 MB of memory in use
  140. Info: NONBONDED TABLE R-SQUARED SPACING: 0.0625
  141. Info: NONBONDED TABLE SIZE: 769 POINTS
  142. Info: INCONSISTENCY IN FAST TABLE ENERGY VS FORCE: 0.000325096 AT 11.9556
  143. Info: INCONSISTENCY IN SCOR TABLE ENERGY VS FORCE: 3.42196e-09 AT 0.0732877
  144. Info: INCONSISTENCY IN VDWA TABLE ENERGY VS FORCE: 0.0040507 AT 0.251946
  145. Info: INCONSISTENCY IN VDWB TABLE ENERGY VS FORCE: 0.00150189 AT 0.251946
  146. Info: Startup phase 2 took 0.00039506 s, 29.7422 MB of memory in use
  147. Info: Startup phase 3 took 2.98023e-05 s, 29.7422 MB of memory in use
  148. Info: Startup phase 4 took 3.09944e-05 s, 29.7422 MB of memory in use
  149. Info: Startup phase 5 took 2.31266e-05 s, 29.7422 MB of memory in use
  150. Info: PATCH GRID IS 4 BY 4 BY 4
  151. Info: PATCH GRID IS 1-AWAY BY 1-AWAY BY 1-AWAY
  152. Info: REMOVING COM VELOCITY -0.0427619 0.00282063 0.007983
  153. Info: LARGEST PATCH (26) HAS 434 ATOMS
  154. Info: TORUS A SIZE 4 USING 0
  155. Info: TORUS B SIZE 1 USING 0
  156. Info: TORUS C SIZE 1 USING 0
  157. Info: TORUS MINIMAL MESH SIZE IS 1 BY 1 BY 1
  158. Info: Placed 100% of base nodes on same physical node as patch
  159. Info: Startup phase 6 took 0.00122404 s, 31.0312 MB of memory in use
  160. Info: MSM extending minimum X to -5 A
  161. Info: MSM extending maximum X to 60 A
  162. Info: MSM extending minimum Y to -5 A
  163. Info: MSM extending maximum Y to 60 A
  164. Info: MSM extending minimum Z to -15 A
  165. Info: MSM extending maximum Z to 46 A
  166. Info: MSM using C1 cubic interpolation
  167. Info: MSM using C2 Taylor splitting function
  168. Info: MSM block size decomposition along X is 8 grid points
  169. Info: MSM block size decomposition along Y is 8 grid points
  170. Info: MSM block size decomposition along Z is 8 grid points
  171. Info: MSM grid spacing is 2.5 A
  172. Info: MSM non-periodic padding is 2.5 A
  173. Info: MSM using 3 levels
  174. Info:     level 0:  [-1..31] x [-1..31] x [-1..29]
  175. Info:     level 1:  [-2..17] x [-2..17] x [-2..16]
  176. Info:     level 2:  [-2..10] x [-2..10] x [-2..9]
  177. Info: MSM finished calculating stencils
  178. Info: MSM finished creating map for grid levels
  179. Info: MSM finished creating map for patches
  180. Info: MSM has 64 interpolation / anterpolation objects (one per patch)
  181. Info: Startup phase 7 took 0.00227284 s, 35.3086 MB of memory in use
  182. Info: Updated CUDA force table with 4096 elements.
  183. Info: Updated CUDA LJ table with 119 x 119 elements.
  184. Info: Startup phase 8 took 0.386101 s, 373.355 MB of memory in use
  185. Info: Startup phase 9 took 8.01086e-05 s, 373.355 MB of memory in use
  186. Info: Startup phase 10 took 2.19345e-05 s, 373.355 MB of memory in use
  187. Using MsmBlockMap for level 0
  188. Using MsmBlockMap for level 1
  189. Using MsmBlockMap for level 2
  190. Using MsmGridCutoffMap
  191. Info: MSM grid level 0 decomposed into 100 blocks ( 5 x 5 x 4 )
  192. Info: MSM grid level 1 decomposed into 27 blocks ( 3 x 3 x 3 )
  193. Info: MSM grid level 2 decomposed into 8 blocks ( 2 x 2 x 2 )
  194. Info: MSM grid cutoff calculation decomposed into 4627 work objects
  195. Info: Startup phase 11 took 0.0184541 s, 400.121 MB of memory in use
  196. LDB: Central LB being created...
  197. Info: Startup phase 12 took 9.70364e-05 s, 400.121 MB of memory in use
  198. Info: CREATING 1016 COMPUTE OBJECTS
  199. Info: Found 213 unique exclusion lists needing 616 bytes
  200. Info: useSync: 0 useProxySync: 0
  201. Info: Startup phase 13 took 0.00332999 s, 401.887 MB of memory in use
  202. Info: Startup phase 14 took 8.39233e-05 s, 401.887 MB of memory in use
  203. Info: Startup phase 15 took 0.000450134 s, 402.828 MB of memory in use
  204. Info: Finished startup at 0.500522 s, 402.828 MB of memory in use
  205.  
  206. TCL: Minimizing for 100 steps
  207. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  208.  
  209. ENERGY:       0       263.6137       847.5817       263.7656        10.7300         -17411.2811      1948.8609        69.9277         0.0000         0.0000         -14006.8016         0.0000    -14006.8016    -14006.8016         0.0000
  210.  
  211. MINIMIZER SLOWLY MOVING 2 ATOMS WITH BAD CONTACTS DOWNHILL
  212. ENERGY:       1       263.2889       846.9560       263.8744        10.9840         -17411.4389      1712.7022        69.9277         0.0000         0.0000         -14243.7057         0.0000    -14243.7057    -14243.7057         0.0000
  213.  
  214. MINIMIZER STARTING CONJUGATE GRADIENT ALGORITHM
  215. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 7.43593e+06 TO 7435.93
  216. ENERGY:       2       181.9587       778.1009       262.9572        10.0059         -17435.7920      1446.6803        69.7579         0.0000         0.0000         -14686.3311         0.0000    -14686.3311    -14686.3311         0.0000
  217.  
  218. ENERGY:       3       151.8348       728.3569       262.2271        10.2835         -17459.8532      1337.0639        69.5884         0.0000         0.0000         -14900.4986         0.0000    -14900.4986    -14900.4986         0.0000
  219.  
  220. ENERGY:       4       172.9369       696.7816       261.6604        11.5709         -17483.6167      1279.7083        69.4194         0.0000         0.0000         -14991.5392         0.0000    -14991.5392    -14991.5392         0.0000
  221.  
  222. ENERGY:       5       244.8764       682.4151       261.2327        13.7147         -17507.0706      1243.6465        69.2508         0.0000         0.0000         -14991.9343         0.0000    -14991.9343    -14991.9343         0.0000
  223.  
  224. ENERGY:       6       366.7599       684.1465       260.9491        16.6128         -17530.2464      1218.2894        69.0826         0.0000         0.0000         -14914.4061         0.0000    -14914.4061    -14914.4061         0.0000
  225.  
  226. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000126623 0.000126623 DU -0.3951 77.5282 DUDX -342262 302368 877739
  227. ENERGY:       7       202.9952       687.8041       261.4244        12.5540         -17495.4572      1259.9292        69.3341         0.0000         0.0000         -15001.4162         0.0000    -15001.4162    -15001.4162         0.0000
  228.  
  229. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 6.39583e-05 6.26649e-05 DU -9.87701 9.48191 DUDX -342262 -7074.68 302368
  230. MINIMIZER RESTARTING CONJUGATE GRADIENT ALGORITHM
  231. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 1.23985e+06 TO 1239.85
  232. ENERGY:       8       104.3437       651.3655       260.8088        11.5798         -17532.3775      1244.6885        69.0905         0.0000         0.0000         -15190.5006         0.0000    -15190.5006    -15190.5006         0.0000
  233.  
  234. ENERGY:       9        70.9660       622.8523       260.2180        11.0080         -17568.9394      1231.6551        68.8478         0.0000         0.0000         -15303.3922         0.0000    -15303.3922    -15303.3922         0.0000
  235.  
  236. LDB: ============= START OF LOAD BALANCING ============== 0.856978
  237. LDB: ============== END OF LOAD BALANCING =============== 0.857063
  238. Info: useSync: 0 useProxySync: 0
  239. LDB: =============== DONE WITH MIGRATION ================ 0.857321
  240. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  241.  
  242. ENERGY:      10       102.2108       602.9857       259.6667        10.8782         -17605.1497      1221.1184        68.6058         0.0000         0.0000         -15339.6840         0.0000    -15339.6840    -15339.6840         0.0000
  243.  
  244. ENERGY:      11       197.0773       592.8015       259.2461        11.2795         -17640.9362      1213.6023        68.3647         0.0000         0.0000         -15298.5647         0.0000    -15298.5647    -15298.5647         0.0000
  245.  
  246. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000183131 0.000183131 DU -36.2919 41.1193 DUDX -408184 11492.1 436540
  247. ENERGY:      12        96.2050       604.5673       259.7180        10.8694         -17601.5076      1222.0513        68.6300         0.0000         0.0000         -15339.4667         0.0000    -15339.4667    -15339.4667         0.0000
  248.  
  249. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 1.83131e-05 0.000183131 DU -0.217284 41.1193 DUDX -30673.3 11492.1 436540
  250. ENERGY:      13       100.6744       603.3742       259.6791        10.8756         -17604.2433      1221.3470        68.6118         0.0000         0.0000         -15339.6812         0.0000    -15339.6812    -15339.6812         0.0000
  251.  
  252. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 4.5052e-06 0.000183131 DU -0.0028556 41.1193 DUDX 1111.8 11492.1 436540
  253. ENERGY:      14       102.2111       602.9968       259.6666        10.8782         -17605.1445      1221.1228        68.6058         0.0000         0.0000         -15339.6631         0.0000    -15339.6631    -15339.6631         0.0000
  254.  
  255. MINIMIZER RESTARTING CONJUGATE GRADIENT ALGORITHM
  256. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 667800 TO 667.8
  257. ENERGY:      15        58.1733       572.3163       260.1761         8.2138         -17662.3636      1186.9111        68.1718         0.0000         0.0000         -15508.4012         0.0000    -15508.4012    -15508.4012         0.0000
  258.  
  259. ENERGY:      16        96.6230       552.0369       260.7816         7.1280         -17718.4900      1157.8971        67.7404         0.0000         0.0000         -15576.2830         0.0000    -15576.2830    -15576.2830         0.0000
  260.  
  261. ENERGY:      17       218.4236       540.7801       261.5590         7.0194         -17773.4517      1132.6811        67.3117         0.0000         0.0000         -15545.6767         0.0000    -15545.6767    -15545.6767         0.0000
  262.  
  263. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000329925 0.000329925 DU -67.8818 30.6063 DUDX -357648 -56251 238395
  264. ENERGY:      18       113.2150       549.2793       260.9126         7.0449         -17728.9663      1152.8860        67.6593         0.0000         0.0000         -15577.9692         0.0000    -15577.9692    -15577.9692         0.0000
  265.  
  266. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 6.22694e-05 0.000267655 DU -1.68618 32.2925 DUDX -56251 -142.183 238395
  267. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 684824 TO 684.824
  268. ENERGY:      19        83.4051       477.3936       262.7825         8.0788         -17911.1407      1091.8473        66.2264         0.0000         0.0000         -15921.4071         0.0000    -15921.4071    -15921.4071         0.0000
  269.  
  270. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  271.  
  272. ENERGY:      20        63.8239       429.9971       266.3352        12.9991         -18081.2109      1042.2040        64.8225         0.0000         0.0000         -16201.0291         0.0000    -16201.0291    -16201.0291         0.0000
  273.  
  274. MINIMIZER RESTARTING CONJUGATE GRADIENT ALGORITHM DUE TO POOR PROGRESS
  275. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 325985 TO 325.985
  276. ENERGY:      21        44.3387       408.7314       265.6040        11.3049         -18139.5252      1033.4451        64.2483         0.0000         0.0000         -16311.8528         0.0000    -16311.8528    -16311.8528         0.0000
  277.  
  278. ENERGY:      22        92.3728       397.6995       265.0751         9.8631         -18196.6902      1025.9002        63.6784         0.0000         0.0000         -16342.1011         0.0000    -16342.1011    -16342.1011         0.0000
  279.  
  280. ENERGY:      23       206.8809       398.4928       264.7304         8.7110         -18252.6520      1019.7393        63.1129         0.0000         0.0000         -16290.9846         0.0000    -16290.9846    -16290.9846         0.0000
  281.  
  282. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000462592 0.000462592 DU -30.2483 51.1164 DUDX -152834 22225.4 198825
  283. ENERGY:      24        82.5726       398.4972       265.1314        10.0315         -18189.4834      1026.7849        63.7504         0.0000         0.0000         -16342.7154         0.0000    -16342.7154    -16342.7154         0.0000
  284.  
  285. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000403918 5.86737e-05 DU -30.8626 0.614341 DUDX -152834 -72.9911 22225.4
  286. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 455923 TO 455.923
  287. ENERGY:      25        74.4858       345.2359       264.0672         9.3367         -18387.5112       988.3728        61.6044         0.0000         0.0000         -16644.4085         0.0000    -16644.4085    -16644.4085         0.0000
  288.  
  289. ENERGY:      26        78.5351       312.4048       265.2097        18.5145         -18568.4928       958.6734        59.5202         0.0000         0.0000         -16875.6350         0.0000    -16875.6350    -16875.6350         0.0000
  290.  
  291. MINIMIZER RESTARTING CONJUGATE GRADIENT ALGORITHM DUE TO POOR PROGRESS
  292. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 354431 TO 354.431
  293. ENERGY:      27        49.2845       295.8408       265.1177        11.0827         -18595.0372       952.0521        59.1306         0.0000         0.0000         -16962.5287         0.0000    -16962.5287    -16962.5287         0.0000
  294.  
  295. ENERGY:      28        71.2510       288.9842       266.0754         8.6142         -18621.3493       946.0185        58.7431         0.0000         0.0000         -16981.6629         0.0000    -16981.6629    -16981.6629         0.0000
  296.  
  297. ENERGY:      29       143.2606       290.7464       267.5509         9.1350         -18647.3008       940.5081        58.3575         0.0000         0.0000         -16937.7423         0.0000    -16937.7423    -16937.7423         0.0000
  298.  
  299. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000345723 0.000345723 DU -19.1342 43.9205 DUDX -150954 38192.9 213354
  300. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  301.  
  302. ENERGY:      30        62.6427       289.6488       265.8288         8.8265         -18616.0054       947.2061        58.8220         0.0000         0.0000         -16983.0305         0.0000    -16983.0305    -16983.0305         0.0000
  303.  
  304. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000275141 7.05817e-05 DU -20.5018 1.36762 DUDX -150954 661.169 38192.9
  305. ENERGY:      31        59.8568       290.0066       265.7386         8.9450         -18613.8697       947.6751        58.8528         0.0000         0.0000         -16982.7947         0.0000    -16982.7947    -16982.7947         0.0000
  306.  
  307. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 2.75141e-05 7.05817e-05 DU -0.235786 1.36762 DUDX -14118.1 661.169 38192.9
  308. ENERGY:      32        62.3497       289.6821       265.8196         8.8374         -18615.7845       947.2513        58.8251         0.0000         0.0000         -16983.0193         0.0000    -16983.0193    -16983.0193         0.0000
  309.  
  310. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 2.75141e-06 7.05817e-05 DU -0.0111798 1.36762 DUDX -813.162 661.169 38192.9
  311. ENERGY:      33        62.6132       289.6520       265.8279         8.8276         -18615.9845       947.2114        58.8223         0.0000         0.0000         -16983.0300         0.0000    -16983.0300    -16983.0300         0.0000
  312.  
  313. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 2.75141e-07 7.05817e-05 DU -0.000468944 1.36762 DUDX 513.738 661.169 38192.9
  314. ENERGY:      34        62.6427       289.6488       265.8288         8.8265         -18616.0075       947.2061        58.8220         0.0000         0.0000         -16983.0325         0.0000    -16983.0325    -16983.0325         0.0000
  315.  
  316. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 224972 TO 224.972
  317. ENERGY:      35        47.1292       276.0648       268.3439        10.4855         -18706.6676       932.4024        57.5297         0.0000         0.0000         -17114.7120         0.0000    -17114.7120    -17114.7120         0.0000
  318.  
  319. ENERGY:      36        59.8632       280.0904       272.4544        20.9337         -18794.1848       919.7074        56.2596         0.0000         0.0000         -17184.8762         0.0000    -17184.8762    -17184.8762         0.0000
  320.  
  321. ENERGY:      37       103.2675       302.4444       277.8999        42.5177         -18878.4047       909.2229        55.0105         0.0000         0.0000         -17188.0418         0.0000    -17188.0418    -17188.0418         0.0000
  322.  
  323. ENERGY:      38       179.3230       343.6665       284.5313        76.8999         -18959.4084       901.1191        53.7819         0.0000         0.0000         -17120.0867         0.0000    -17120.0867    -17120.0867         0.0000
  324.  
  325. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000713722 0.000713722 DU -3.16563 67.9551 DUDX -52637.6 44599.7 146225
  326. ENERGY:      39        79.5817       289.9901       275.2633        31.1841         -18840.3689       913.7129        55.5750         0.0000         0.0000         -17195.0618         0.0000    -17195.0618    -17195.0618         0.0000
  327.  
  328. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.00038914 0.000324582 DU -10.1856 7.01996 DUDX -52637.6 -425.534 44599.7
  329. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  330.  
  331. ENERGY:      40        81.6502       291.0622       275.5151        32.2003         -18844.2438       913.2419        55.5183         0.0000         0.0000         -17195.0559         0.0000    -17195.0559    -17195.0559         0.0000
  332.  
  333. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.00038914 3.24582e-05 DU -10.1856 0.00594148 DUDX -52637.6 -425.534 4020.86
  334. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 399386 TO 399.386
  335. ENERGY:      41        63.6612       259.9702       274.6675        25.9142         -19064.4394       883.5309        51.9776         0.0000         0.0000         -17504.7178         0.0000    -17504.7178    -17504.7178         0.0000
  336.  
  337. ENERGY:      42       134.8937       266.7962       274.4698        24.4155         -19259.1350       863.9811        48.5967         0.0000         0.0000         -17645.9820         0.0000    -17645.9820    -17645.9820         0.0000
  338.  
  339. ENERGY:      43       294.0943       311.2045       275.0433        26.1123         -19427.5944       854.0044        45.3587         0.0000         0.0000         -17621.7769         0.0000    -17621.7769    -17621.7769         0.0000
  340.  
  341. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000988016 0.000988016 DU -141.264 24.2051 DUDX -227844 -58171.2 107604
  342. ENERGY:      44       180.9759       278.1495       274.5777        24.7030         -19321.1260       859.3749        47.4367         0.0000         0.0000         -17655.9083         0.0000    -17655.9083    -17655.9083         0.0000
  343.  
  344. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000347612 0.000640404 DU -9.92633 34.1314 DUDX -58171.2 438.12 107604
  345. ENERGY:      45       175.8767       276.8096       274.5627        24.6582         -19315.0340       859.7815        47.5513         0.0000         0.0000         -17655.7940         0.0000    -17655.7940    -17655.7940         0.0000
  346.  
  347. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 3.47612e-05 0.000640404 DU -0.114346 34.1314 DUDX -5439.68 438.12 107604
  348. ENERGY:      46       180.4610       278.0134       274.5761        24.6984         -19320.5095       859.4162        47.4482         0.0000         0.0000         -17655.8961         0.0000    -17655.8961    -17655.8961         0.0000
  349.  
  350. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 3.47612e-06 0.000640404 DU -0.0121859 34.1314 DUDX -149.931 438.12 107604
  351. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 826231 TO 826.231
  352. ENERGY:      47       100.0878       260.7120       272.8307        20.8819         -19399.9867       854.1285        45.8801         0.0000         0.0000         -17845.4657         0.0000    -17845.4657    -17845.4657         0.0000
  353.  
  354. ENERGY:      48        70.3531       255.0555       271.4296        17.7529         -19474.3084       850.8230        44.3464         0.0000         0.0000         -17964.5478         0.0000    -17964.5478    -17964.5478         0.0000
  355.  
  356. ENERGY:      49        90.4339       262.5216       270.3928        15.4437         -19543.5350       849.5463        42.8469         0.0000         0.0000         -18012.3499         0.0000    -18012.3499    -18012.3499         0.0000
  357.  
  358. LDB: ============= START OF LOAD BALANCING ============== 2.29967
  359. LDB: Partitioning computes with target load 0.000000
  360. LDB: Increased migratable compute count from 0 to 0
  361. LDB: Largest unpartitionable compute is 0.000000
  362. LDB: ============== END OF LOAD BALANCING =============== 2.30237
  363. Info: useSync: 0 useProxySync: 0
  364. LDB: =============== DONE WITH MIGRATION ================ 2.30254
  365. Info: Initial time: 4 CPUs 0.0357787 s/step 0.207053 days/ns 424.203 MB memory
  366. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  367.  
  368. ENERGY:      50       159.2459       284.5640       269.7314        14.3952         -19607.4938       850.3748        41.3806         0.0000         0.0000         -17987.8019         0.0000    -17987.8019    -17987.8019         0.0000
  369.  
  370. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000271569 0.000271569 DU -47.8021 24.548 DUDX -306971 -41644.9 228146
  371. ENERGY:      51        98.0762       264.9702       270.2635        15.1750         -19553.9282       849.5338        42.6126         0.0000         0.0000         -18013.2970         0.0000    -18013.2970    -18013.2970         0.0000
  372.  
  373. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 4.28266e-05 0.000228743 DU -0.947114 25.4951 DUDX -41644.9 462.874 228146
  374. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 397928 TO 397.928
  375. ENERGY:      52        49.3304       244.4711       268.7562        12.0173         -19622.2067       847.4816        40.9649         0.0000         0.0000         -18159.1854         0.0000    -18159.1854    -18159.1854         0.0000
  376.  
  377. ENERGY:      53        70.2019       244.0136       268.6401        11.6466         -19686.1626       847.9133        39.3581         0.0000         0.0000         -18204.3890         0.0000    -18204.3890    -18204.3890         0.0000
  378.  
  379. ENERGY:      54       161.1922       262.5593       269.9467        13.7580         -19745.7185       850.8213        37.7919         0.0000         0.0000         -18149.6491         0.0000    -18149.6491    -18149.6491         0.0000
  380.  
  381. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000493528 0.000493528 DU -45.2036 54.7398 DUDX -193203 10513.1 211627
  382. ENERGY:      55        64.9495       243.1693       268.5858        11.5686         -19679.9334       847.7495        39.5162         0.0000         0.0000         -18204.3945         0.0000    -18204.3945    -18204.3945         0.0000
  383.  
  384. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000444176 4.93528e-05 DU -45.2091 0.00549117 DUDX -193203 -9861.25 10513.1
  385. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 181593 TO 181.593
  386. ENERGY:      56        56.8729       229.3131       267.6109        12.4643         -19759.7923       841.6064        37.5485         0.0000         0.0000         -18314.3763         0.0000    -18314.3763    -18314.3763         0.0000
  387.  
  388. ENERGY:      57       133.3451       243.5367       267.3139        16.6381         -19835.7085       838.3441        35.6437         0.0000         0.0000         -18300.8869         0.0000    -18300.8869    -18300.8869         0.0000
  389.  
  390. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.00094364 0.00094364 DU -109.982 13.4894 DUDX -181593 -51344.4 79900.5
  391. ENERGY:      58        76.7845       231.5024       267.3983        13.6145         -19789.9371       839.9876        36.7959         0.0000         0.0000         -18323.8539         0.0000    -18323.8539    -18323.8539         0.0000
  392.  
  393. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000369066 0.000574574 DU -9.47756 22.967 DUDX -51344.4 -202.405 79900.5
  394. ENERGY:      59        81.0432       232.2309       267.3755        13.8440         -19794.5940       839.7742        36.6796         0.0000         0.0000         -18323.6466         0.0000    -18323.6466    -18323.6466         0.0000
  395.  
  396. LDB: ============= START OF LOAD BALANCING ============== 2.65947
  397. LDB: ============== END OF LOAD BALANCING =============== 2.65956
  398. Info: useSync: 0 useProxySync: 0
  399. LDB: =============== DONE WITH MIGRATION ================ 2.6598
  400. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000369066 5.74574e-05 DU -9.47756 0.207295 DUDX -51344.4 -202.405 7778.75
  401. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  402.  
  403. ENERGY:      60        77.1962       231.5705       267.3959        13.6369         -19790.4057       839.9666        36.7842         0.0000         0.0000         -18323.8553         0.0000    -18323.8553    -18323.8553         0.0000
  404.  
  405. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 5.74574e-06 5.17117e-05 DU -0.00146843 0.208764 DUDX -202.405 595.258 7778.75
  406. ENERGY:      61        77.0518       231.5465       267.3968        13.6290         -19790.2433       839.9735        36.7883         0.0000         0.0000         -18323.8574         0.0000    -18323.8574    -18323.8574         0.0000
  407.  
  408. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 3.73581e-06 2.00993e-06 DU -0.00348932 0.00202089 DUDX -202.405 316.013 595.258
  409. ENERGY:      62        77.0179       231.5409       267.3970        13.6272         -19790.1995       839.9766        36.7892         0.0000         0.0000         -18323.8506         0.0000    -18323.8506    -18323.8506         0.0000
  410.  
  411. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 4.72215e-07 2.00993e-06 DU -0.00672897 0.00202089 DUDX 250.62 316.013 595.258
  412. ENERGY:      63        77.0518       231.5465       267.3968        13.6290         -19790.2434       839.9735        36.7883         0.0000         0.0000         -18323.8574         0.0000    -18323.8574    -18323.8574         0.0000
  413.  
  414. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 214987 TO 214.987
  415. ENERGY:      64        69.8493       227.9253       267.3454        10.5904         -19927.3978       828.6561        33.3364         0.0000         0.0000         -18489.6950         0.0000    -18489.6950    -18489.6950         0.0000
  416.  
  417. ENERGY:      65       160.2703       262.5603       268.2227        12.4202         -20052.6718       824.4751        30.0982         0.0000         0.0000         -18494.6250         0.0000    -18494.6250    -18494.6250         0.0000
  418.  
  419. ENERGY:      66       340.8096       335.0372       270.1526        18.8480         -20165.6323       827.5615        27.0731         0.0000         0.0000         -18346.1504         0.0000    -18346.1504    -18346.1504         0.0000
  420.  
  421. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.00115306 0.00115306 DU -4.93001 148.475 DUDX -73723.1 61889 188710
  422. ENERGY:      67       106.1888       241.5452       267.6715        10.9867         -19995.2582       825.5164        31.5843         0.0000         0.0000         -18511.7652         0.0000    -18511.7652    -18511.7652         0.0000
  423.  
  424. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000613786 0.000539275 DU -22.0703 17.1402 DUDX -73723.1 -862.953 61889
  425. ENERGY:      68       110.6769       243.2577       267.7152        11.0849         -20001.0764       825.3395        31.4334         0.0000         0.0000         -18511.5688         0.0000    -18511.5688    -18511.5688         0.0000
  426.  
  427. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000613786 5.39275e-05 DU -22.0703 0.196468 DUDX -73723.1 -862.953 5469.88
  428. ENERGY:      69       106.6283       241.7128       267.6758        10.9961         -19995.8672       825.4983        31.5692         0.0000         0.0000         -18511.7868         0.0000    -18511.7868    -18511.7868         0.0000
  429.  
  430. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 5.39275e-06 4.85347e-05 DU -0.0215915 0.21806 DUDX -862.953 -229.18 5469.88
  431. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  432.  
  433. ENERGY:      70       107.0257       241.8642       267.6797        11.0046         -19996.3850       825.4804        31.5556         0.0000         0.0000         -18511.7748         0.0000    -18511.7748    -18511.7748         0.0000
  434.  
  435. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 5.39275e-06 4.85347e-06 DU -0.0215915 0.0120685 DUDX -862.953 -229.18 341.468
  436. ENERGY:      71       106.6680       241.7278       267.6762        10.9969         -19995.9187       825.4965        31.5678         0.0000         0.0000         -18511.7855         0.0000    -18511.7855    -18511.7855         0.0000
  437.  
  438. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 5.39275e-06 4.85347e-07 DU -0.0215915 0.00133228 DUDX -862.953 -229.18 -172.022
  439. ENERGY:      72       106.6283       241.7128       267.6758        10.9961         -19995.8664       825.4983        31.5692         0.0000         0.0000         -18511.7860         0.0000    -18511.7860    -18511.7860         0.0000
  440.  
  441. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 329515 TO 329.515
  442. ENERGY:      73        74.1316       242.4130       268.1700        12.7027         -20150.9901       818.7515        27.4076         0.0000         0.0000         -18707.4138         0.0000    -18707.4138    -18707.4138         0.0000
  443.  
  444. ENERGY:      74       178.9203       287.6227       269.7344        21.0585         -20285.1260       823.9361        23.6320         0.0000         0.0000         -18680.2219         0.0000    -18680.2219    -18680.2219         0.0000
  445.  
  446. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000923202 0.000923202 DU -195.628 27.1918 DUDX -329515 -93324.6 152070
  447. ENERGY:      75        97.5105       254.3904       268.6473        14.9313         -20204.3902       819.2989        25.9268         0.0000         0.0000         -18723.6851         0.0000    -18723.6851    -18723.6851         0.0000
  448.  
  449. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000350866 0.000572336 DU -16.2714 43.4632 DUDX -93324.6 -1139.4 152070
  450. ENERGY:      76       103.2263       256.9547       268.7394        15.3955         -20212.8302       819.5534        25.6906         0.0000         0.0000         -18723.2704         0.0000    -18723.2704    -18723.2704         0.0000
  451.  
  452. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000350866 5.72336e-05 DU -16.2714 0.414769 DUDX -93324.6 -1139.4 14032.7
  453. ENERGY:      77        98.0579       254.6389       268.6563        14.9764         -20205.2315       819.3222        25.9031         0.0000         0.0000         -18723.6766         0.0000    -18723.6766    -18723.6766         0.0000
  454.  
  455. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000350866 5.72336e-06 DU -16.2714 0.00857249 DUDX -93324.6 -1139.4 375.238
  456. ENERGY:      78        97.6283       254.4438       268.6493        14.9410         -20204.5604       819.3033        25.9217         0.0000         0.0000         -18723.6730         0.0000    -18723.6730    -18723.6730         0.0000
  457.  
  458. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000350866 1.23638e-06 DU -16.2714 0.0121016 DUDX -93324.6 -1139.4 -812.882
  459. ENERGY:      79        97.5105       254.3902       268.6473        14.9313         -20204.3874       819.2988        25.9268         0.0000         0.0000         -18723.6826         0.0000    -18723.6826    -18723.6826         0.0000
  460.  
  461. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 341105 TO 341.105
  462. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  463.  
  464. ENERGY:      80        59.6565       254.8028       267.7088        11.7902         -20334.8250       820.6735        22.3213         0.0000         0.0000         -18897.8720         0.0000    -18897.8720    -18897.8720         0.0000
  465.  
  466. ENERGY:      81       145.5416       303.1432       268.3773        11.8798         -20445.8429       833.1191        19.1028         0.0000         0.0000         -18864.6791         0.0000    -18864.6791    -18864.6791         0.0000
  467.  
  468. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000813395 0.000813395 DU -174.189 33.1928 DUDX -341105 -87069.2 168838
  469. ENERGY:      82        75.0943       265.7459       267.7582        11.4945         -20374.7524       823.6375        21.1819         0.0000         0.0000         -18909.8401         0.0000    -18909.8401    -18909.8401         0.0000
  470.  
  471. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000276913 0.000536482 DU -11.9681 45.161 DUDX -87069.2 -198.62 168838
  472. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 221377 TO 221.377
  473. ENERGY:      83        55.1333       252.8840       266.2713         9.6585         -20462.6403       828.7049        18.9123         0.0000         0.0000         -19031.0760         0.0000    -19031.0760    -19031.0760         0.0000
  474.  
  475. ENERGY:      84       109.0647       264.6443       265.9937        12.0153         -20542.1310       839.1495        16.8432         0.0000         0.0000         -19034.4203         0.0000    -19034.4203    -19034.4203         0.0000
  476.  
  477. ENERGY:      85       237.0179       300.2390       266.9800        18.1784         -20613.0251       855.0701        14.9702         0.0000         0.0000         -18920.5696         0.0000    -18920.5696    -18920.5696         0.0000
  478.  
  479. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000813436 0.000813436 DU -3.34426 113.851 DUDX -76471.9 68488.8 212182
  480. ENERGY:      86        74.3902       256.1329       265.9531        10.4071         -20505.5768       833.5418        17.7951         0.0000         0.0000         -19047.3567         0.0000    -19047.3567    -19047.3567         0.0000
  481.  
  482. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.00042975 0.000383686 DU -16.2807 12.9364 DUDX -76471.9 105.155 68488.8
  483. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 188849 TO 188.849
  484. ENERGY:      87        63.4209       244.1312       265.2583        12.2318         -20586.7054       841.7356        15.9663         0.0000         0.0000         -19143.9613         0.0000    -19143.9613    -19143.9613         0.0000
  485.  
  486. ENERGY:      88       124.9241       257.0435       264.9663        15.7901         -20661.5639       853.9630        14.2994         0.0000         0.0000         -19130.5775         0.0000    -19130.5775    -19130.5775         0.0000
  487.  
  488. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000801393 0.000801393 DU -96.6046 13.3838 DUDX -188849 -51916.7 85772.5
  489. ENERGY:      89        78.2457       246.0077       265.0985        13.3709         -20615.7603       845.8731        15.3166         0.0000         0.0000         -19151.8476         0.0000    -19151.8476    -19151.8476         0.0000
  490.  
  491. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000303172 0.000498221 DU -7.88631 21.2701 DUDX -51916.7 62.4784 85772.5
  492. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 174790 TO 174.79
  493. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  494.  
  495. ENERGY:      90        69.4975       234.1547       264.4653        13.1881         -20705.2595       856.7482        13.5272         0.0000         0.0000         -19253.6784         0.0000    -19253.6784    -19253.6784         0.0000
  496.  
  497. ENERGY:      91       123.4351       251.0244       264.7772        15.6590         -20787.9090       872.3953        11.9327         0.0000         0.0000         -19248.6853         0.0000    -19248.6853    -19248.6853         0.0000
  498.  
  499. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.000890949 0.000890949 DU -101.831 4.99301 DUDX -174790 -54000.9 64720.2
  500. ENERGY:      92        86.2408       238.2000       264.5017        14.0332         -20743.5451       863.2298        12.7808         0.0000         0.0000         -19264.5587         0.0000    -19264.5587    -19264.5587         0.0000
  501.  
  502. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.00040359 0.000487359 DU -10.8804 15.8734 DUDX -54000.9 67.3676 64720.2
  503. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 162703 TO 162.703
  504. ENERGY:      93        89.3459       237.3047       263.7928        12.7880         -20856.2787       881.8313        10.8571         0.0000         0.0000         -19360.3589         0.0000    -19360.3589    -19360.3589         0.0000
  505.  
  506. ENERGY:      94       214.0959       276.7644       264.1749        14.3026         -20957.3026       908.3327         9.2533         0.0000         0.0000         -19270.3788         0.0000    -19270.3788    -19270.3788         0.0000
  507.  
  508. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.00115624 0.00115624 DU -95.8001 89.9801 DUDX -162703 -3004.07 157441
  509. ENERGY:      95        96.3046       239.4335       263.7848        12.8134         -20866.8593       884.1110        10.6829         0.0000         0.0000         -19359.7291         0.0000    -19359.7291    -19359.7291         0.0000
  510.  
  511. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 0.00115624 0.000115624 DU -95.8001 0.629746 DUDX -162703 -3004.07 12953
  512. ENERGY:      96        90.4896       237.6294       263.7954        12.7904         -20858.1359       882.2240        10.8264         0.0000         0.0000         -19360.3807         0.0000    -19360.3807    -19360.3807         0.0000
  513.  
  514. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 2.05513e-05 9.50723e-05 DU -0.0217612 0.651507 DUDX -3004.07 -222.767 12953
  515. ENERGY:      97        91.0341       237.7975       263.7940        12.7919         -20858.9694       882.4102        10.8120         0.0000         0.0000         -19360.3297         0.0000    -19360.3297    -19360.3297         0.0000
  516.  
  517. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 2.05513e-05 9.50723e-06 DU -0.0217612 0.0509901 DUDX -3004.07 -222.767 1094.72
  518. ENERGY:      98        90.5438       237.6461       263.7953        12.7905         -20858.2186       882.2442        10.8250         0.0000         0.0000         -19360.3738         0.0000    -19360.3738    -19360.3738         0.0000
  519.  
  520. LINE MINIMIZER BRACKET: DX 2.05513e-05 9.50723e-07 DU -0.0217612 0.00688475 DUDX -3004.07 -222.767 -90.885
  521. ENERGY:      99        90.4896       237.6294       263.7954        12.7904         -20858.1362       882.2240        10.8264         0.0000         0.0000         -19360.3809         0.0000    -19360.3809    -19360.3809         0.0000
  522.  
  523. LDB: ============= START OF LOAD BALANCING ============== 4.09916
  524. LDB: TIME 4.10196 LOAD: AVG 1.3953 MAX 1.42832  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 None MEM: 428.066 MB
  525. LDB: TIME 4.10198 LOAD: AVG 1.3953 MAX 1.42832  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 TorusLB MEM: 428.066 MB
  526. LDB: ============== END OF LOAD BALANCING =============== 4.10215
  527. Info: useSync: 0 useProxySync: 0
  528. LDB: =============== DONE WITH MIGRATION ================ 4.10231
  529. LINE MINIMIZER REDUCING GRADIENT FROM 143841 TO 143.841
  530. Info: Initial time: 4 CPUs 0.0359399 s/step 0.207985 days/ns 428.324 MB memory
  531. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  532.  
  533. ENERGY:     100        90.4896       237.6294       263.7954        12.7904         -20858.1398       882.2236        10.8264         0.0000         0.0000         -19360.3849         0.0000    -19360.3849    -19360.3849         0.0000
  534.  
  535. REINITIALIZING VELOCITIES AT STEP 100 TO 310 KELVIN.
  536. TCL: Running for 2500 steps
  537. ENERGY:     100        90.4896       237.6294       263.7954        12.7904         -20858.1397       882.2236        10.8264         0.0000      4200.8896         -15159.4953       302.7329    -19360.3849    -15166.8578       302.7329
  538.  
  539. LDB: ============= START OF LOAD BALANCING ============== 5.07468
  540. LDB: TIME 5.0776 LOAD: AVG 0.925216 MAX 0.942616  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 None MEM: 431.418 MB
  541. LDB: TIME 5.07763 LOAD: AVG 0.925216 MAX 0.942616  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 RefineTorusLB MEM: 431.418 MB
  542. LDB: TIME 5.07764 LOAD: AVG 0.925216 MAX 0.942616  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 RefineTorusLB MEM: 431.418 MB
  543. LDB: ============== END OF LOAD BALANCING =============== 5.07781
  544. Info: useSync: 0 useProxySync: 0
  545. LDB: =============== DONE WITH MIGRATION ================ 5.07796
  546. Info: Initial time: 4 CPUs 0.0194815 s/step 0.11274 days/ns 431.418 MB memory
  547. LDB: ============= START OF LOAD BALANCING ============== 6.02448
  548. LDB: TIME 6.02733 LOAD: AVG 0.891309 MAX 0.90715  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 None MEM: 433.992 MB
  549. LDB: TIME 6.02734 LOAD: AVG 0.891309 MAX 0.90715  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 RefineTorusLB MEM: 433.992 MB
  550. LDB: TIME 6.02736 LOAD: AVG 0.891309 MAX 0.90715  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 RefineTorusLB MEM: 433.992 MB
  551. LDB: ============== END OF LOAD BALANCING =============== 6.02752
  552. Info: useSync: 0 useProxySync: 0
  553. LDB: =============== DONE WITH MIGRATION ================ 6.02766
  554. Info: Benchmark time: 4 CPUs 0.0189181 s/step 0.109479 days/ns 434.508 MB memory
  555. ENERGY:     200       169.3284       519.5411       306.1187        32.1864         -21475.6084      1682.9014         6.9304         0.0000      3716.7418         -15041.8603       267.8433    -18758.6021    -15033.8878       243.4387
  556.  
  557. Info: Benchmark time: 4 CPUs 0.0184612 s/step 0.106835 days/ns 434.766 MB memory
  558. OPENING COORDINATE DCD FILE
  559. WRITING COORDINATES TO DCD FILE ubq_ws_eq.dcd AT STEP 250
  560. The last position output (seq=250) takes 0.000 seconds, 434.766 MB of memory in use
  561. Info: Benchmark time: 4 CPUs 0.0184516 s/step 0.10678 days/ns 435.02 MB memory
  562. ENERGY:     300       189.2599       529.8988       292.6653        28.5906         -21817.0667      1758.1166         3.7841         0.0000      3952.0373         -15062.7142       284.7996    -19014.7515    -15051.8376       280.3173
  563.  
  564. Info: Benchmark time: 4 CPUs 0.0185607 s/step 0.107411 days/ns 435.277 MB memory
  565. Info: Benchmark time: 4 CPUs 0.0181844 s/step 0.105234 days/ns 435.535 MB memory
  566. ENERGY:     400       216.6998       568.4397       306.7635        38.0685         -21931.4554      1713.6871         4.1858         0.0000      4064.1397         -15019.4713       292.8782    -19083.6110    -15007.5269       290.5144
  567.  
  568. Info: Benchmark time: 4 CPUs 0.0182518 s/step 0.105624 days/ns 435.535 MB memory
  569. ENERGY:     500       199.6512       604.9653       297.9612        34.6105         -21945.5495      1658.6695         3.3540         0.0000      4103.0012         -15043.3365       295.6787    -19146.3377    -15029.7393       295.3954
  570.  
  571. WRITING EXTENDED SYSTEM TO RESTART FILE AT STEP 500
  572. WRITING COORDINATES TO DCD FILE ubq_ws_eq.dcd AT STEP 500
  573. WRITING COORDINATES TO RESTART FILE AT STEP 500
  574. FINISHED WRITING RESTART COORDINATES
  575. The last position output (seq=500) takes 0.000 seconds, 435.535 MB of memory in use
  576. WRITING VELOCITIES TO RESTART FILE AT STEP 500
  577. FINISHED WRITING RESTART VELOCITIES
  578. The last velocity output (seq=500) takes 0.000 seconds, 435.535 MB of memory in use
  579. ENERGY:     600       219.1430       571.3118       305.0802        35.5195         -21946.1216      1610.2676         2.2221         0.0000      4214.5607         -14988.0169       303.7181    -19202.5775    -14974.3126       298.1323
  580.  
  581. ENERGY:     700       196.1206       608.9272       330.7440        31.1674         -22303.3122      1873.4078         6.2772         0.0000      4228.2347         -15028.4334       304.7035    -19256.6681    -15012.9606       303.5689
  582.  
  583. WRITING COORDINATES TO DCD FILE ubq_ws_eq.dcd AT STEP 750
  584. The last position output (seq=750) takes 0.000 seconds, 436.102 MB of memory in use
  585. ENERGY:     800       212.5658       637.2236       320.6815        42.9848         -22102.5192      1739.6215         1.3659         0.0000      4079.9233         -15068.1527       294.0156    -19148.0760    -15052.4911       303.3639
  586.  
  587. ENERGY:     900       220.2987       624.2354       317.2127        38.1431         -21980.1520      1517.6056         4.4748         0.0000      4249.2711         -15008.9105       306.2195    -19258.1816    -14994.9831       302.9403
  588.  
  589. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  590.  
  591. ENERGY:    1000       201.1507       655.5185       315.9607        38.6971         -22100.4621      1615.0467         2.3915         0.0000      4255.1125         -15016.5845       306.6404    -19271.6970    -15000.2426       305.3844
  592.  
  593. WRITING EXTENDED SYSTEM TO RESTART FILE AT STEP 1000
  594. WRITING COORDINATES TO DCD FILE ubq_ws_eq.dcd AT STEP 1000
  595. WRITING COORDINATES TO RESTART FILE AT STEP 1000
  596. FINISHED WRITING RESTART COORDINATES
  597. The last position output (seq=1000) takes 0.000 seconds, 436.102 MB of memory in use
  598. WRITING VELOCITIES TO RESTART FILE AT STEP 1000
  599. FINISHED WRITING RESTART VELOCITIES
  600. The last velocity output (seq=1000) takes 0.000 seconds, 436.102 MB of memory in use
  601. ENERGY:    1100       224.5950       652.0332       318.4086        33.7561         -21908.1809      1519.8682         6.3879         0.0000      4173.8770         -14979.2549       300.7863    -19153.1319    -14962.5963       303.6617
  602.  
  603. ENERGY:    1200       211.7386       654.2695       338.4308        39.4673         -22078.0495      1573.7068         5.4205         0.0000      4289.1738         -14965.8422       309.0950    -19255.0160    -14951.4639       305.2044
  604.  
  605. WRITING COORDINATES TO DCD FILE ubq_ws_eq.dcd AT STEP 1250
  606. The last position output (seq=1250) takes 0.000 seconds, 436.359 MB of memory in use
  607. ENERGY:    1300       220.3639       666.9054       302.6235        34.9457         -22030.1539      1586.8067         5.3426         0.0000      4258.3806         -14954.7855       306.8759    -19213.1661    -14937.3730       305.0112
  608.  
  609. ENERGY:    1400       226.3117       640.6028       314.2320        42.4481         -21842.7630      1421.1930         8.6529         0.0000      4174.1333         -15015.1892       300.8047    -19189.3225    -14997.7532       304.6655
  610.  
  611. ENERGY:    1500       197.0062       645.3462       291.6384        35.0859         -21926.2091      1570.7017        10.0452         0.0000      4216.6864         -14959.6993       303.8713    -19176.3856    -14944.4247       302.3592
  612.  
  613. WRITING EXTENDED SYSTEM TO RESTART FILE AT STEP 1500
  614. WRITING COORDINATES TO DCD FILE ubq_ws_eq.dcd AT STEP 1500
  615. WRITING COORDINATES TO RESTART FILE AT STEP 1500
  616. FINISHED WRITING RESTART COORDINATES
  617. The last position output (seq=1500) takes 0.000 seconds, 436.359 MB of memory in use
  618. WRITING VELOCITIES TO RESTART FILE AT STEP 1500
  619. FINISHED WRITING RESTART VELOCITIES
  620. The last velocity output (seq=1500) takes 0.000 seconds, 436.359 MB of memory in use
  621. ENERGY:    1600       235.0531       664.6529       323.1244        42.0426         -21978.4683      1519.1630         1.5389         0.0000      4258.6177         -14934.2757       306.8930    -19192.8934    -14918.9080       302.7283
  622.  
  623. ENERGY:    1700       202.7423       704.8681       307.9923        36.8508         -22045.0522      1584.4294        10.3818         0.0000      4293.4662         -14904.3213       309.4043    -19197.7875    -14890.4918       307.8220
  624.  
  625. WRITING COORDINATES TO DCD FILE ubq_ws_eq.dcd AT STEP 1750
  626. The last position output (seq=1750) takes 0.000 seconds, 436.359 MB of memory in use
  627. ENERGY:    1800       219.6816       662.6008       313.3389        43.4269         -21936.0823      1576.3699         3.0204         0.0000      4230.7142         -14886.9296       304.8822    -19117.6438    -14869.8169       306.4181
  628.  
  629. ENERGY:    1900       225.9133       662.1706       312.6011        46.4252         -21911.1862      1535.4978         7.7617         0.0000      4256.4969         -14864.3197       306.7402    -19120.8165    -14848.1552       307.3957
  630.  
  631. TIMING: 2000  CPU: 39.396, 0.018924/step  Wall: 39.4931, 0.0189737/step, 0.00316228 hours remaining, 436.359375 MB of memory in use.
  632. ETITLE:      TS           BOND          ANGLE          DIHED          IMPRP               ELECT            VDW       BOUNDARY           MISC        KINETIC               TOTAL           TEMP      POTENTIAL         TOTAL3        TEMPAVG
  633.  
  634. ENERGY:    2000       217.8830       696.4044       310.2163        39.8208         -21933.3446      1554.7830         8.0937         0.0000      4256.0201         -14850.1232       306.7058    -19106.1433    -14831.1952       309.3856
  635.  
  636. WRITING EXTENDED SYSTEM TO RESTART FILE AT STEP 2000
  637. WRITING COORDINATES TO DCD FILE ubq_ws_eq.dcd AT STEP 2000
  638. WRITING COORDINATES TO RESTART FILE AT STEP 2000
  639. FINISHED WRITING RESTART COORDINATES
  640. The last position output (seq=2000) takes 0.000 seconds, 436.359 MB of memory in use
  641. WRITING VELOCITIES TO RESTART FILE AT STEP 2000
  642. FINISHED WRITING RESTART VELOCITIES
  643. The last velocity output (seq=2000) takes 0.000 seconds, 436.359 MB of memory in use
  644. ENERGY:    2100       226.2163       680.1033       304.2470        42.6291         -22002.8419      1630.6534         5.5952         0.0000      4306.1408         -14807.2567       310.3177    -19113.3974    -14789.4282       307.6241
  645.  
  646. LDB: ============= START OF LOAD BALANCING ============== 42.7844
  647. LDB: ============== END OF LOAD BALANCING =============== 42.7845
  648. Info: useSync: 0 useProxySync: 0
  649. LDB: =============== DONE WITH MIGRATION ================ 42.7848
  650. LDB: ============= START OF LOAD BALANCING ============== 43.7337
  651. LDB: TIME 43.7365 LOAD: AVG 0.896456 MAX 0.917749  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 None MEM: 438.938 MB
  652. LDB: TIME 43.7365 LOAD: AVG 0.896456 MAX 0.917749  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 RefineTorusLB MEM: 438.938 MB
  653. LDB: TIME 43.7365 LOAD: AVG 0.896456 MAX 0.917749  PROXIES: TOTAL 57 MAXPE 22 MAXPATCH 3 RefineTorusLB MEM: 438.938 MB
  654. LDB: ============== END OF LOAD BALANCING =============== 43.7367
  655. Info: useSync: 0 useProxySync: 0
  656. LDB: =============== DONE WITH MIGRATION ================ 43.7369
  657. ENERGY:    2200       223.4376       659.3036       298.2309        39.0787         -21858.0560      1473.6041         5.6797         0.0000      4330.0721         -14828.6493       312.0423    -19158.7214    -14808.5689       309.7801
  658.  
  659. WRITING COORDINATES TO DCD FILE ubq_ws_eq.dcd AT STEP 2250
  660. The last position output (seq=2250) takes 0.000 seconds, 439.195 MB of memory in use
  661. ENERGY:    2300       215.4656       659.7474       310.8158        41.1706         -21943.3429      1487.8026         3.9390         0.0000      4349.1959         -14875.2059       313.4204    -19224.4019    -14853.8593       306.6753
  662.  
  663. ENERGY:    2400       220.9170       696.4125       308.1203        42.0896         -21886.6184      1491.8511         3.0707         0.0000      4264.1151         -14860.0420       307.2892    -19124.1571    -14844.3791       310.0026
  664.  
  665. ENERGY:    2500       201.0159       682.2193       307.0860        42.2375         -21999.2099      1606.5195         3.3624         0.0000      4319.6965         -14837.0728       311.2946    -19156.7692    -14817.9693       309.7826
  666.  
  667. WRITING EXTENDED SYSTEM TO RESTART FILE AT STEP 2500
  668. WRITING COORDINATES TO DCD FILE ubq_ws_eq.dcd AT STEP 2500
  669. WRITING COORDINATES TO RESTART FILE AT STEP 2500
  670. FINISHED WRITING RESTART COORDINATES
  671. The last position output (seq=2500) takes 0.000 seconds, 439.195 MB of memory in use
  672. WRITING VELOCITIES TO RESTART FILE AT STEP 2500
  673. FINISHED WRITING RESTART VELOCITIES
  674. The last velocity output (seq=2500) takes 0.000 seconds, 439.195 MB of memory in use
  675. ENERGY:    2600       219.8360       665.1735       325.1524        44.6944         -21816.8479      1458.0948         1.7962         0.0000      4263.8846         -14838.2161       307.2726    -19102.1006    -14820.9319       309.0553
  676.  
  677. WRITING EXTENDED SYSTEM TO OUTPUT FILE AT STEP 2600
  678. WRITING COORDINATES TO OUTPUT FILE AT STEP 2600
  679. CLOSING COORDINATE DCD FILE ubq_ws_eq.dcd
  680. WRITING VELOCITIES TO OUTPUT FILE AT STEP 2600
  681. ====================================================
  682.  
  683. WallClock: 51.328018  CPUTime: 51.127998  Memory: 439.195312 MB
  684. [Partition 0][Node 0] End of program
RAW Paste Data
We use cookies for various purposes including analytics. By continuing to use Pastebin, you agree to our use of cookies as described in the Cookies Policy. OK, I Understand
 
Top