Product.update({
        _id:{$in:connected},
        connectedFarms:{$not:{$elemMatch:{_id:farm._id}}}
      },{
        $push:{connectedFarms:{_id:farm._id}}
      },{
        multi:true
      })

Product.find({
_id:{$in:connected},
connectedFarms:{$not:{$elemMatch:{_id:farm._id}}}
})