Чтобы свойство src фрейма изменить, надо ссылкам добавить:
<a href="history.html" target="content" onclick="window.opener.resetsrc('history.html')">История</a>

function resetsrc(url){
document.getElementById("content").setAttribute("src",url);
}

И в фреймсете:
<frame src="pages/main.php" frame name="content">