<figure class="class"><iframe src="src" width="xxx" height="xxx"></iframe></figure>

<figure class="class"><iframe><iframe src="src" width="xxx" height="xxx"></iframe><iframe></figure>

foreach ($iframes as $iframeViejo) {
    //Crear un nuevo iframe y asignar el src
    $iframeMainn = $doc->createElement('iframe');
    $iframeNuevo->setAttribute('src', $iframeViejo->getAttribute('src'));
    $iframeNuevo->setAttribute('width','560');
    $iframeNuevo->setAttribute('height','615');
    //Crear un nuevo figure y agregarle el nuevo iframe
    $figureNuevo = $doc->createElement('figure');
    $figureNuevo->setAttribute('class','op-interactive');
    $figureNuevo->appendChild($iframeNuevo);
    //reemplazar viejo por nuevo
    $iframeViejo->parentNode->replaceChild($figureNuevo, $iframeViejo);
}