//Classe gerada automaticamente pelo EF
public partial class BaseClassPartialTests
{
    public string PropTeste1 { get; set; }
    public string PropTeste2 { get; set; }
    public string PropTeste3 { get; set; }
}

//Como a classe gerada pelo EF é uma Partial Class,
//basta criar, em outro arquivo, uma outra classe parcial herdando da interface que eu quero.
public partial class BaseClassPartialTests : IBaseProps
{
    public BaseClassPartialTests()
    {
        PropTeste1 = PropTeste2 = PropTeste3 = string.Empty;
    }
}

//Interface para aplicar nas classes.
public interface IBaseProps
{
    string PropTeste1 { get; set; }
    string PropTeste2 { get; set; }
}