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By: a guest on Jul 8th, 2011  |  syntax: Bash  |  size: 5.81 KB  |  hits: 73  |  expires: Never
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  1. ==> Downloading seaview...
  2. ==> Customizing seaview...
  3. ==> WARNING: Packages from the AUR are potentially dangerous!
  4. Edit the PKGBUILD? (recommended) [Y/n] n
  5. Edit the seaview.install? (recommended) [Y/n] n
  6. ==> Making package: seaview 4.2.12-3 (Fri Jul  8 13:57:05 CLT 2011)
  7. ==> Checking runtime dependencies...
  8. ==> Checking buildtime dependencies...
  9. ==> Retrieving Sources...
  10.   -> Downloading seaview.tar.gz...
  11. --2011-07-08 13:57:05--  http://pbil.univ-lyon1.fr/software/seaview_data/seaview.tar.gz
  12. Resolving pbil.univ-lyon1.fr... 134.214.32.76
  13. Connecting to pbil.univ-lyon1.fr|134.214.32.76|:80... connected.
  14. HTTP request sent, awaiting response... 200 OK
  15. Length: 302933 (296K) [application/x-gzip]
  16. Saving to: “seaview.tar.gz.part”
  17.  
  18. 100%[======================================>] 302,933     40.2K/s   in 7.4s    
  19.  
  20. 2011-07-08 13:57:14 (40.2 KB/s) - “seaview.tar.gz.part” saved [302933/302933]
  21.  
  22.   -> Downloading seaview_4.2.12-1.debian.tar.gz...
  23. --2011-07-08 13:57:14--  http://ftp.de.debian.org/debian/pool/non-free/s/seaview/seaview_4.2.12-1.debian.tar.gz
  24. Resolving ftp.de.debian.org... 141.76.2.4
  25. Connecting to ftp.de.debian.org|141.76.2.4|:80... connected.
  26. HTTP request sent, awaiting response... 200 OK
  27. Length: 16348 (16K) [application/x-gzip]
  28. Saving to: “seaview_4.2.12-1.debian.tar.gz.part”
  29.  
  30. 100%[======================================>] 16,348      20.2K/s   in 0.8s    
  31.  
  32. 2011-07-08 13:57:15 (20.2 KB/s) - “seaview_4.2.12-1.debian.tar.gz.part” saved [16348/16348]
  33.  
  34.   -> Found seaview_black.patch
  35.   -> Found consensus_100.patch
  36. ==> Validating source files with md5sums...
  37.     seaview.tar.gz ... Passed
  38.     seaview_4.2.12-1.debian.tar.gz ... Passed
  39.     seaview_black.patch ... Passed
  40.     consensus_100.patch ... Passed
  41. ==> Extracting Sources...
  42.   -> Extracting seaview.tar.gz with bsdtar
  43.   -> Extracting seaview_4.2.12-1.debian.tar.gz with bsdtar
  44. ==> Entering fakeroot environment...
  45. ==> Starting build()...
  46. patching file seaview.cxx
  47. Hunk #1 succeeded at 4625 (offset 3 lines).
  48. patching file seaview.cxx
  49. Hunk #1 succeeded at 4908 (offset 3 lines).
  50. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF custom.cxx
  51. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF use_mase_files.cxx
  52. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF regions.cxx
  53. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF load_seq.cxx
  54. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF align.cxx
  55. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF xfmatpt.cxx
  56. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF comlines.cxx
  57. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF resource.cxx
  58. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF nexus.cxx
  59. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF viewasprots.cxx
  60. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF racnuc_fetch.cxx
  61. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF concatenate.cxx
  62. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF csrc/raa_acnuc.c
  63. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF csrc/parser.c
  64. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF csrc/md5.c
  65. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF csrc/zsockr.c
  66. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF csrc/misc_acnuc.c
  67. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF FL/Fl_Native_File_Chooser_FLTK.cxx
  68. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF trees.cxx
  69. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF treedraw.cxx
  70. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF addbootstrap.cxx
  71. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF least_squares_brl.cxx
  72. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF  csrc/dnapars.c
  73. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF  csrc/protpars.c
  74. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF  csrc/lwl.c
  75. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF csrc/bionj.c
  76. gcc -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF csrc/phyml_util.c
  77. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF pseudoterminal.cxx
  78. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF unrooted.cxx
  79. g++ -c -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF postscript.cxx
  80. g++ -o seaview   -DUSE_XFT -I/usr/include/freetype2 -DFLTK1 -Dunix -O3  -Icsrc -I.    -DNO_PDF seaview.cxx custom.o use_mase_files.o regions.o load_seq.o align.o xfmatpt.o comlines.o resource.o nexus.o viewasprots.o racnuc_fetch.o concatenate.o raa_acnuc.o parser.o md5.o zsockr.o misc_acnuc.o Fl_Native_File_Chooser_FLTK.o trees.o treedraw.o addbootstrap.o least_squares_brl.o dnapars.o protpars.o lwl.o bionj.o phyml_util.o pseudoterminal.o unrooted.o postscript.o  \
  81.        -lfltk_images -lfltk  \
  82.      -lXft -lXext -lfontconfig -ljpeg -lpng  \
  83.          -lX11 -lm -lz    
  84. seaview.cxx: In function ‘SEA_VIEW* create_the_form(int)’:
  85. seaview.cxx:4978:2: error: incomplete type ‘Fl_X’ used in nested name specifier
  86. make: *** [seaview] Error 1
  87. ==> ERROR: A failure occurred in build().
  88.     Aborting...
  89. sudo clyde -S seaview  165.09s user 11.46s system 49% cpu 5:53.39 total
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